4D7P型

肠道贾第鞭毛虫超氧化物还原酶(1Fe-SOR)


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.00 Å
  • R值自由:0.231 
  • R值工作:0.195 
  • 观察到的R值:0.196 

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文学

肠道贾第鞭毛虫超氧化物还原酶:真核生物第一Sor的结构特征显示出对光还原高度敏感的铁中心。

苏萨,C.M。卡彭蒂尔,P。P.M.马蒂亚斯。泰斯塔,F。F.皮尼奥。P·萨蒂。A.朱弗尔。T.M.班德拉斯。科罗拉多州罗马奥。

(2015)Acta Crystallogr D生物晶体仪71: 2236

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S1399004715015825
  • 相关结构的主要引文:
    4BGL公司,4d7便士

  • PubMed摘要:

    超氧化物还原酶(SOR)通常存在于原核生物中,通过将超氧化物阴离子还原为过氧化氢来保护其免受氧化应激。该反应是在铁中心催化的,铁中心在迄今为止具有结构特征的原核SOR中高度保守。本文报道了真核生物原生动物寄生虫肠道贾第鞭毛虫(Girdia intestualis,GiSOR)SOR的第一个结构,其分辨率为2.0º。通过使用同步辐射X射线从同一闪速冷却蛋白质晶体中收集100K下的多组衍射数据,观察到铁中心的光还原。在铁位在谷氨酸结合的氧化状态下的647 nm吸收带特征衰减后,使用在线紫外可见显微分光光度计监测还原。与迄今为止在结构上表征的其他1Fe-SOR类似,该酶显示出四聚体四元结构排列。作为一个独特的特征,蛋白质的N末端环含有特征性的EKHxP基序,无论铁氧化还原状态如何,都显示出异常高的灵活性。与先前通过原核SORs的X射线晶体学和傅里叶变换红外光谱收集的证据不同,铁还原没有导致谷氨酸从催化金属中解离或其他结构变化;然而,谷氨酸配体经历了X射线诱导的化学变化,揭示了GiSOR活性位点对X射线辐射损伤的高度敏感性。


  • 组织附属关系

    葡萄牙奥埃拉斯新里斯本安托尼奥·泽维尔大学科技研究所(2780-157)。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
超氧化物还原酶111肠贾第鞭毛虫突变: 0 
欧盟委员会:1.15.1.2
UniProt公司
寻找蛋白质V6TJK7型 (肠道贾第鞭毛虫)
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转到UniProtKB:V6TJK7型
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团V6TJK7型
序列注释
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小分子
配体1独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥二维示意图3D交互
FE公司
FE查询

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B[认证A]FE(III)离子

VTLYFUHAOXGGBS-UHFFFAOYSA-N公司
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.00 Å
  • R值自由:0.231 
  • R值工作:0.195 
  • 观察到的R值:0.196 
  • 空间组:I 2 3号机组
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=90.27α = 90
b=90.27β = 90
c=90.27γ=90
软件包:
软件名称目的
菲尼克斯精炼
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