4AI7公司

嗜热Thermus thermophilus HB27漆酶的晶体结构与汞络合,脱辅基酶的晶体在278K的5mM HgCl2中浸泡2h。


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.70 Å
  • R值自由:0.170 
  • R值工作:0.152 
  • 观察到的R值:0.153美元

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文学

X射线诱导多铜氧化酶的催化活性位还原:质子中继机制和O2还原状态的结构观察。

塞拉诺·波萨达,H。森特诺·莱亚(Centeno-Leija,S.)。Rojas Trejo,S.P.公司。罗德里格斯-阿尔马赞,C。V·斯托亚诺夫。Rudino-Pinera,E。

(2015)Acta Crystallogr D生物晶体仪71: 2396

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S1399004715018714
  • 相关结构的主要引文:
    2XU9型,2个UW,第26页,2年,2年,2是的,2年,2号机组,2年,2年,2年,4AI7公司

  • PubMed摘要:

    在从多铜氧化酶(MCO)晶体收集X射线数据的过程中,电子和质子主要通过水分子的辐解释放到系统中,导致X射线在酶的三核铜簇(TNC)处将O2还原为2H2O。在这项工作中,测定了嗜热Thermus thermophilus HB27多铜氧化酶(Tth-MCO)在全息、载脂蛋白和汞结合形式以及不同X射线吸收剂量下的12种晶体结构。在具有四个Cu原子的完整Tth-MCO结构中,参与O2还原的质子供体残基Glu451以双重构象存在:Glu451a(TNC中的~7º)和Glu45lb(TNC的~4.5º)。Glu451a O(ℇ2)的Fo-Fc图中电子密度高于3.5σ的正峰表明侧链上存在羧基官能团,而其在Glu451 b中的显著缺失强烈表明存在羧酸官能团。相反,对于apo-Tth MCO和Hg结合结构,既没有观察到正峰,也没有观察到双重构象。总之,这些观察结果为MCO家族中的质子中继机制提供了第一个结构证据,也支持了之前的研究,这些研究表明Asp106不为该机制提供质子。此外,具有不同X射线吸收剂量的八种复合结构(Tth-MCO-C1-8)允许观察不同的O2还原状态,并且在剂量高于0.2时T2Cu的总消耗量MGy显示了该铜原子对辐射损伤的高度敏感性,强调了在MCO结构的生化解释中考虑辐射效应的重要性。


  • 组织附属关系

    Medicina Molecular y Bioprocesos,墨西哥国立墨西哥自治大学生物技术研究所,阿维尼达大学,2001年,墨西哥MOR,62210 Cuernavaca。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
类漆酶蛋白439嗜热Thermus thermophilus HB27突变: 0 
欧盟委员会:1.10.3.2
UniProt公司
寻找蛋白质第72季度 (嗜热Thermus thermophilus(菌株ATCC BAA-163/DSM 7039/HB27))
转到UniProtKB:Q72HW2号机组
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团Q72HW2号机组
序列注释
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  • 参考序列
小分子
配体2独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥2D图表3D交互
HG公司
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B[认证A],
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汞(II)离子

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MPD公司
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N[认证A],
O[认证A],
P[认证A],
Q[认证A],
R[认证A],
S[认证A],
T[认证A],
U[验证A]
(4S)-2-甲基-2,4-戊二醇
C6H(H)14O(运行)2
SVTBMSDMJJWYQN-YFKPBYRVSA-N型
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.70 Å
  • R值自由:0.170 
  • R值工作:0.152美元
  • 观察到的R值:0.153 
  • 空间组:C 2 2 21
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=93.276α = 90
b=110.1β = 90
c=96.214γ=90
软件包:
软件名称目的
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XDS公司数据缩减
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