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PDBx/mmCIF格式(gz)
二进制CIF格式(gz)
PDB格式
PDB格式(gz)
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结构系数(CIF)
结构系数(CIF-gz)
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验证(XML-gz)
验证(CIF-gz)
生物组件1(CIF-gz)
生物组件1(PDB-gz)
fo-fc地图(DSN6)
2fo-fc地图(DSN6)
地图系数(MTZ格式)
数据API
3X2Z(3X2Z)
海洋热藻金属-β-乳糖酶与镍配合物的晶体结构
PDB内政部:
https://doi.org/10.2210/pdb3X2Z/pdb
分类:
水解酶
生物体:
海洋热藻MSB8
表达式系统:
大肠杆菌
突变:
没有
存款:
2015-01-07
发布时间:
2016-02-17
存款作者:
H.J.Choi。
,
H.J.金。
,
松浦,A。
,
米卡米,B。
,
H.J.尹。
,
H.H.李。
实验数据快照
方法:
X射线衍射
分辨率:
2.33 Å
R值自由:
0.205
R值工作:
0.191
观察到的R值:
0.191年
wwPDB验证
3D报告
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历史
.
文学类
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下载门德利
海洋热藻金属-β-乳糖酶与镍配合物的晶体结构
H.J.Choi。
,
H.J.金。
,
A.松浦。
,
米卡米,B。
,
H.J.尹。
,
H.H.李。
待发布。
非对称单元
生物组件1
上一个
下一步
高分子含量
结构总重量:74.55 kDa
原子数:5534
模拟残留物计数:681
沉积残留物计数:681
独特的蛋白质链:1
大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:
顺序
100%
95%
90%
80%
70%
60%
50%
40%
30%
(通过身份截止)|
3D结构
实体ID:1
分子
链条
序列长度
有机体
细节
图像
UPF0173金属依赖性水解酶TM_1162
A类
,
B类
,
C类
227
海洋热藻MSB8
突变
:0
基因名称:
TM_1162
UniProt公司
寻找蛋白质
问题9X0P5
(嗜热菌(菌株ATCC 43589/DSM 3109/JCM 10099/NBRC 100826/MSB8))
探索
问题9X0P5
转到UniProtKB:
问题9X0P5
实体组
序列簇
30%身份
50%身份
70%身份
90%身份
95%身份
100%身份
UniProt集团
问题9X0P5
序列注释
展开
参考序列
小分子
配体
1独特
身份证
链条
姓名/配方/InChI密钥
二维示意图
3D交互
镍
NI查询
下载理想坐标CCD文件
下载实例坐标
SDF格式,链D[auth A]
SDF格式,链E[auth A]
SDF格式,链F[auth B]
SDF格式,链G[auth B]
SDF格式,链H[auth C]
SDF格式,链I[auth C]
MOL2格式,链D[auth A]
MOL2格式,链E[auth A]
MOL2格式,链F[auth B]
MOL2格式,链G[auth B]
MOL2格式,链H[auth C]
MOL2格式,链I[auth C]
D[认证A]
E[认证A]
F[认证B]
G[认证B]
H[认证C]
D[认证A],
E[认证A],
F[认证B],
G[认证B],
H[身份验证C],
身份证
减去
镍(II)离子
镍
VEQPNABPJHWNSG-UHFFFAOYSA-N公司
互动
焦点链D[auth A]
焦点链E[auth A]
焦点链F[auth B]
焦点链G[auth B]
焦点链H[auth C]
焦点链I[auth C]
相互作用和密度
焦点链D[auth A]
焦点链E[auth A]
焦点链F[auth B]
焦点链G[auth B]
焦点链H[auth C]
焦点链I[auth C]
实验数据和验证
实验数据
方法:
X射线衍射
分辨率:
2.33 Å
R值自由:
0.205
R值工作:
0.191
观察到的R值:
0.191
空间组:
第4页
1
2
1
2
单位单元格
:
长度(Ω)
角度(˚)
a=143.538
α = 90
b=143.538
β=90
c=149.853
γ = 90
软件包:
软件名称
目的
HKL-2000
数据收集
CCP4型
模型建筑物
REFMAC公司
精炼
HKL-2000
数据缩减
HKL-2000
数据缩放
CCP4型
阶段划分
结构验证
查看
完整验证报告
查看更深入的实验数据
进入历史记录
存款数据
发布日期:
2016-02-17
存款作者:
H.J.Choi。
,
H.J.金。
,
A.松浦。
,
米卡米,B。
,
H.J.尹。
,
H.H.李。
修订历史记录
(完整详细信息和数据文件)
版本1.0:2016-02-17
类型:首次发布
版本1.1:2024-03-20
更改:数据收集、数据库引用、派生计算
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