2V98型

经9秒退火至室温后,TcAChE与1-(2-硝基苯)-2,2,2-三氟乙基-砷酰氯的络合物的结构,在前5秒期间发生266nm的激光照射


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:3.00 Å
  • R值自由:0.249 
  • R值工作:0.202 
  • 观察到的R值:0.202 

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文学类

利用“笼状”模拟物通过动力学晶体学研究乙酰胆碱酯酶中胆碱的转运

J.-P.科利蒂尔。A.Royant。Specht,A.公司。桑森,B。纳雄,F。马森,P。G.扎卡伊。苏斯曼,J.L。戈德纳,M。西尔曼,我。资产阶级,D。M.威克。

(2007)Acta Crystallogr D生物晶体仪63: 1115

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S0907444907044472
  • 相关结构的主要引文:
    2伏96,2伏97,2V98型,2VA9型

  • PubMed摘要:

    乙酰胆碱酯酶在胆碱能突触的神经脉冲传递中起着关键作用。尽管其活动场所被掩埋,但其营业额仍然很高,这一明显的悖论引发了令人信服的问题,即在这种情况下,基板和产品进出活动场所的流量是如何如此迅速地发生的。在此,提出了一种动态晶体学策略,旨在从结构上解决乙酰胆碱酯酶中产品流动的问题,其中在温度控制的X射线晶体学体系中,对酶产品类似物砷胆碱的光敏前体“笼状”砷胆碱进行紫外线诱导的裂解。“笼状”砷胆碱在乙酰胆碱酯酶的活性位点和外周位点都能结合。在从100 K到室温的短暂温度漂移期间,对乙酰胆碱酯酶复合物进行紫外线照射,很可能导致笼状化合物的占用率降低。显微分光光度实验表明,笼状化合物确实已被光分解。有人提出,晶体中释放的一部分砷胆碱分子已经从活性位点和外围位点排出。部分q加权差分精细化揭示了乙酰胆碱酯酶中两个结构域在光解和室温漂移后的相对运动,导致不对称单元的单体a和单体B的活性位点谷体积分别增加30%和35%。此外,通向酶活性位点峡谷的另一条途径似乎打开了。乙酰胆碱酯酶“起作用”的这种结构特征与胆碱在催化后通过峡谷或另一种“后门”轨迹从酶中退出的观点一致。


  • 组织附属关系

    法国格勒诺布尔生物结构研究所Moléculaire生物物理实验室,Jean-Pierre EBEL,UMR 5075 CNRS-CEA-UJF,38027。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
乙酰胆碱酯酶537加利福尼亚州Tetronarce突变: 0 
欧盟委员会:3.1.1.7
UniProt公司
寻找蛋白质P04058号 (加利福尼亚州Tetronarce)
探索P04058 
转到UniProtKB:P04058号
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团P04058号
序列注释
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  • 参考序列
小分子
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:3.00 Å
  • R值自由:0.249美元
  • R值工作:0.202 
  • 观察到的R值:0.202 
  • 空间组:第2页12121
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=91.62α = 90
b=104.47β = 90
c=148.8γ = 90
软件包:
软件名称目的
中枢神经系统精炼
XDS公司数据缩减
XSCALE公司数据缩放
中枢神经系统阶段划分

结构验证

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  • 版本1.0:2007-11-20
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2011-05-08
    更改:版本格式符合性
  • 版本1.2:2011-07-13
    更改:版本格式符合性
  • 版本1.3:2019-04-03
    更改:数据收集、实验准备、其他
  • 版本1.4:2020-07-29
    类型:补救
    原因:碳水化合物修复
    更改:数据收集、派生计算、其他、结构摘要
  • 版本1.5:2021-05-12
    更改:派生计算、结构摘要
  • 版本1.6:2023-12-13
    更改:数据收集、数据库引用、优化描述