改进辐射损伤子结构以防撕裂。
公共医学 : 16131756 内政部: https://doi.org/10.107/S090744905019360 相关结构的主要引文: 2BLO公司 , 2BLP公司 , 2磅 , 2BLR型 , 2BLU公司 , 2BLV公司 , 2BLW公司 , 2BLX型 , 2年 , 2BLZ公司 , 2BN1型 , 2BN3型 PubMed摘要: 使用辐射损伤诱导定相(RIP)方法,可以使用特定的辐射损伤来解决大分子结构。 使用第三代同步加速器波荡光束线(带有高度衰减光束)上收集的数据集,研究了六种含二硫测试结构(弹性蛋白酶、胰岛素、溶菌酶、核糖核酸酶A、胰蛋白酶和索马丁)的方法。 每个晶体都暴露在“之前”和“之后”数据集收集之间的未衰减X射线束下。 X射线“烧伤”引起的强度差异在5%到15%之间,这取决于所研究的蛋白质。 在SHELXD中,使用综合直接法和Patterson法测定了X射线敏感亚结构。 通过将SHELXC中的“后”数据集按比例因子K缩小,找到最佳子结构,最佳值范围为0.96至0.99。 通过与SHELXE迭代,通过添加负占据位置以及大量相对较弱的位置,改进了初始子结构。 最终的子结构范围从40到300多个站点,最强的峰值高达57西格玛。 除了一个结构外,所有结构都可以解决:不可能找到核糖核酸酶A的初始亚结构,但是,从已知的五个最易感位点开始的SHELXE迭代给出了极好的图谱。 事实证明,对弹性蛋白酶、溶菌酶和索马丁的溶液进行降尺度处理是必要的,并且在其他情况下减少了SHELXE迭代次数。 降尺度和子结构迭代的结合为利用辐射损伤的大分子结构定相提供了重要益处。