第2天第7天

软X射线在高分子晶体学中的常规应用,第三部分——最佳数据采集波长


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.66 Å
  • R值自由:0.202 
  • R值工作:0.174 
  • 观察到的R值:0.175 

wwPDB验证  3D报告 完整报告


这是条目的1.2版。查看完整信息历史


文学类

关于软X射线在大分子晶体学中的常规应用。第三部分:最佳数据收集波长。

米勒-迪克曼,C。南卡罗来纳州潘吉卡。宾夕法尼亚州塔克。医学硕士Weiss。

(2005)Acta Crystallogr D生物晶体仪61: 1263-1272

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S090744905021475
  • 相关结构的主要引文:
    2A7A型,2A7B型,2A7C型,2A7D型,2A7E型,2A7F型,2A7G型,2A7小时,2A7I型,2A7J型

  • PubMed摘要:

    在0.80至2.65 A的不同波长下收集了10个不同蛋白质和DNA模型系统的完整且高度冗余的数据集。发现由商R(anom)/R(R.i.m.)评估的异常信噪比大小受数据收集波长和异常散射子结构性质的影响。通过利用简单的经验相关性,例如在估计的deltaF/F和预期的R(anom)或数据收集波长和预计的R(R.i.m.)之间,甚至可以在实验之前估计出可以预期的最高异常信噪比的波长。几乎和反常散射子结构的性质无关,并且假设附近没有元素X射线吸收边,则最佳波长为2.1A。


  • 组织附属关系

    EMBL汉堡分站,转交DESY,Notkestrasse 85,D-22603 Hamburg,Germany。


大分子
通过以下方式查找相似的蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
溶菌酶C129Gallus胆囊突变: 0 
欧盟委员会:3.2.1.17
UniProt公司
寻找蛋白质P00698号 (五倍子)
探索P00698号 
转到UniProtKB:P00698号
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团P00698号
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体3独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥二维示意图3D交互
XE公司
XE上的查询

下载理想坐标CCD文件
K[认证A],
L[认证A]
氙气
Xe公司
FHNFHKCVQCLJFQ-UHFFFAOYSA-N公司

CL查询

下载理想坐标CCD文件
B[认证A]
C[授权A]
D[认证A]
E[认证A]
F[认证A]
B[认证A],
C[认证A],
D[认证A],
E[认证A],
F[认证A],
G[认证A],
H[认证A],
本人[授权A]
氯离子

VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M公司
不适用
NA查询

下载理想坐标CCD文件
J[认证A]钠离子

FKNQFGJONOIPTF-UHFFFAOYSA-N公司
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:1.66 Å
  • R值自由:0.202 
  • R值工作:0.174 
  • 观察到的R值:0.175 
  • 空间组:第4页212
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=77.05α = 90
b=77.05β = 90
c=37.21γ = 90
软件包:
软件名称目的
REFMAC公司精炼
DENZO公司数据缩减
电子秤组件数据缩放

结构验证

查看完整验证报告



进入历史记录

存款数据

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2005-07-19
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2008-04-30
    更改:版本格式符合性
  • 版本1.2:2011-07-13
    更改:版本格式符合性