2A4牛顿

氨基糖苷6'-N-乙酰转移酶与辅酶A配合物的晶体结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.20 Å
  • R值自由:0.255 
  • R值工作:2006年10月
  • 观察到的R值:0.206 

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文学类

氨基糖苷乙酰转移酶AAC(6')-Ii新晶型的结构:结构和正常模式分析。

D.L.伯克。熊,B。布雷特巴赫,C。伯吉斯,A.M。

(2005)Acta Crystallogr D生物晶体仪61: 1273-1279

  • 内政部:https://doi.org/10.107/S090744905021487
  • 相关结构的主要引文:
    2A4牛顿

  • PubMed摘要:

    氨基糖苷修饰酶氨基糖苷6'-N-乙酰转移酶Ii型[AAC(6')-Ii]与其辅因子辅酶A在空间群C222(1)中结晶,单位-细胞参数A=71.5,b=127.4,c=76.9 A,每个不对称单位有一个生理相关的二聚体物种。之前观察到的该复合物的空间群为P2(1)2(1)2,1,每个不对称单元有两个二聚体。通过比较AAC(6')-Ii-CoA复合体的六种可用原单体结构,可以确定蛋白质中的可塑性区域。该复合体的正态模分析表明,这种可塑性不是晶体堆积力的产物,但显示多种构象的原聚体区域具有内在的灵活性。据推测,灵活性与观察到的酶的协同活性有关。


  • 组织附属关系

    麦吉尔大学生物化学系,740 Dr Penfield Avenue,Montreal,QC,H3A 1A4,Canada。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
aac(6')-Ii182屎肠球菌突变: 0 
基因名称:aac(6')-Ii
欧盟委员会:2.3.1.82
UniProt公司
寻找蛋白质Q47764问题 (屎肠球菌)
探索Q47764问题 
转到UniProtKB:Q47764问题
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团Q47764问题
序列注释
展开
  • 参考序列
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.20 Å
  • R值自由:0.255 
  • R值工作:0.206 
  • 观察到的R值:0.206 
  • 空间组:C 2 2 21
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=71.48α = 90
b=127.35β = 90
c=76.91γ = 90
软件包:
软件名称目的
DENZO公司数据缩减
电子秤组件数据缩放
中枢神经系统精炼
PDB_提取数据提取
中枢神经系统阶段划分

结构验证

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配体结构质量评估


条目历史记录

存款数据

修订历史记录(完整详细信息和数据文件)

  • 版本1.0:2005-09-20
    类型:首次发布
  • 版本1.1:2008-04-30
    更改:版本格式符合性
  • 版本1.2:2011-07-13
    更改:版本格式符合性
  • 版本1.3:2011-11-16
    更改:原子模型
  • 版本1.4:2017-10-11
    更改:咨询、精炼说明
  • 版本1.5:2023-08-23
    更改:咨询、数据收集、数据库参考、派生计算、细化描述