GeneCards: a novel functional genomics compendium with automated data mining and query reformulation support

doi:10.1093/bioinformatics/14.8.656

.1998;14(8):656-64.

doi:10.1093/bioinformatics/14.8656。

GeneCards：一个新的功能基因组学概要，具有自动数据挖掘和查询重新制定支持

M Rebhan先生¹, V查利法·卡斯皮, J普里卢斯基, D柳叶刀

附属公司

PMID： 9789091
内政部： 10.1093/生物信息学/14.8656

GeneCards：一个新的功能基因组学概要，具有自动数据挖掘和查询重新制定支持

M Rebhan先生等。生物信息学. 1998.

.1998;14(8):656-64.

doi:10.1093/bioinformatics/14.8656。

作者

M Rebhan先生¹, V查利法·卡斯皮, J普里卢斯基, D柳叶刀

附属

¹以色列雷霍沃特市魏茨曼科学研究所分子遗传学部、生物服务部（生物信息学单位）和基因组中心，邮编：76100。

PMID： 9789091
内政部： 10.1093/生物信息学/14.8656

摘要

动机：现代生物学正在从“一个基因一个博士后”的方法转向基因组分析，包括同时监测数千个基因。因此，在学术和工业研究中，高效获取简明和综合的生物医学信息以支持数据分析和决策的重要性正在迅速增加。然而，在广泛分布的生物医学研究相关资源中发现知识往往是一项繁琐和非平凡的任务，需要大量的培训和努力。

结果：为了开发一种新型主题特定概述资源的模型，以提供对分布式信息的有效访问，我们设计了一个名为“GeneCards”的数据库。这是一个可自由访问的网络资源，为目前拥有HUGO/GDB命名委员会发布的批准基因符号的7000多个人类基因中的每个基因提供了一张超文本“卡片”。所提供的信息旨在立即深入了解有关各个基因的当前知识，包括其在健康和疾病中的功能。它是由Perl脚本编译的，这些脚本可以自动从几个数据库中提取相关信息，包括SWISS-PROT、OMIM、Genatlas和GDB。对用户与GeneCards Web界面交互的分析引发了针对人类浏览优化的易扫描显示器的开发。此外，我们还开发了一些算法，提供“点击即用”的查询重新格式化支持，以促进信息检索和探索。许多长期用户转向GeneCards，以快速获取关于超大组基因功能的信息，例如在使用“DNA芯片”技术或二维蛋白质电泳的大规模表达研究领域。

可利用性：免费提供地址：网址：http://bioinformatics.weizmann.ac.il/cards/

联系人：cards@bioinformatics.weizmann.ac.il

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