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.1998年8月14日;1373(1):237-51.
doi:10.1016/s0005-2736(98)00111-4。

腐败沙门菌MR-1十血红素外膜细胞色素c基因omcA的分离、序列测定及其他腐败沙门氏菌omcA同源物的检测

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omcA的分离和序列,omcA是编码腐乳杆菌MR-1的十血红素外膜细胞色素c的基因,以及其他腐乳杆菌菌株中omcA同源物的检测

J M迈尔斯等。 Biochim生物物理学报. .
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摘要

测定了omcA基因的序列,该基因编码一种定位于腐败沙瓦氏菌MR-1外膜(OM)的十血红素细胞色素c。omcA的2202 bp核苷酸序列编码734个氨基酸,预测分子蛋白质质量为78.6 kDa。与成熟蛋白质的氨基末端序列比较表明,存在疏水性先导序列,该先导序列在蛋白质向OM的移位过程中被裂解。该先导序列具有信号肽酶II在裂解位点的脂蛋白一致序列。预测的成熟蛋白质由708个氨基酸组成,预测的分子量为75.8 kDa,但添加10个共价连接的血红素c基团和对氨基末端半胱氨酸的共价脂质修饰将预测的质量增加到82.7 kDa。这与其在SDS-PAGE凝胶中83kDa的表观质量一致。OmcA蛋白的预测氨基酸序列与已知蛋白没有显著同源性。在厌氧生长的MR-1细胞中检测到与omcA基因杂交的约2300个碱基的RNA。该转录本的大小与omcA基因的编码区相似,表明它不是多顺反子操纵子的一部分。与MR-1相似,在厌氧条件下生长时,发现其他四株腐败链球菌都将其大部分膜结合细胞色素定位于OM,并且都含有与OmcA大小相似的OM细胞色素。在其中两株菌株MR-4和MR-8中,通过RT-PCR和Southern blotting,使用MR-1的omcA特异性引物和探针鉴定了omcA的同源物。使用OmcA多克隆抗体进行的Western blot分析在MR-4和MR-8菌株中同样呈阳性。对这些同源物的部分核苷酸序列分析表明,与MR-1的OmcA预测的氨基酸同源性为74-77%。相反,菌株MR-30和MR-42经Southern和Northern印迹、RT-PCR和Western印迹检测,omcA同源物呈阴性。

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