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.1998年6月15日;26(12):2941-7.
doi:10.1093/nar/26.12.2941。

在完全测序的细菌基因组中结合不同的基因识别证据

附属公司

在完全测序的细菌基因组中结合不同的基因识别证据

D弗里斯曼等。 核酸研究. .

勘误表in

  • 核酸研究1998年8月15日;26(16):遵循3870

摘要

对新测序的细菌基因组的分析始于蛋白质编码基因的鉴定。蛋白质的功能分配需要蛋白质N末端的精确知识。我们提出了一个新的程序ORPHEUS,用于识别候选基因并准确预测基因启动。分析从数据库相似性搜索和可靠基因片段的识别开始。后者用于推导蛋白质编码区和核糖体结合位点的统计特征,并预测分析基因组中的整套基因。在对枯草芽孢杆菌和大肠杆菌基因组的测试中,该程序正确识别了93.3%(分别为96.3%)的PIR-International数据库中描述的长度超过100个密码子的实验注释基因,并准确预测了这些基因96.3%(83.9%)的启动。此外,在GenBank中发现了98.9%(99.1%)的长度超过100个密码子的基因,92.9%(75.7%)的预测起始点与特征表描述一致。最后,对于枯草芽孢杆菌和大肠杆菌的完整基因补体,包括短于100个密码子的基因,基因预测准确率分别为88.9%和87.1%,94.2%和76.7%与现有注释一致。

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    1. 基因组学。1997年11月15日;46(1):24-36-公共医学
    1. 核酸研究,1998年1月1日;26(1):38-42-公共医学
    1. 核酸研究,1998年2月15日;26(4):1107-15-公共医学
    1. Microb Comp基因组学。1996;1(4):281-91-公共医学
    1. 太平洋交响乐生物计算机。1998;:279-90-公共医学

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