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比较研究
.1997年6月10日;94(12):6070-4.
doi:10.1073/pnas.94.12.6070。

大肠杆菌热休克基因座V(HslV)的晶体结构

附属公司
比较研究

大肠杆菌热休克位点V(HslV)的晶体结构

M波希特勒等。 美国国家科学院程序. .

摘要

热休克位点V(HslV;也称为ClpQ)是大肠杆菌中ATP依赖性蛋白酶HslVU的蛋白水解核心。它和真核和古细菌蛋白酶体的β型亚基序列相似。与这些显示72点对称的粒子不同,它是一个62点对称的六聚体二聚体。通过同晶置换和对称平均确定的3.8-A分辨率的HslV晶体结构表明,尽管粒子的对称性不同,但折叠和亚基之间的接触是守恒的。一种三肽醛抑制剂,乙酰-Leu-Leu-norleucinal,可能以半缩醛的形式与HslV的N末端苏氨酸残基结合,在功能上也与古生菌和真核生物的蛋白酶体相关。

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数字

图1
图1
β-亚基的氨基酸序列比对嗜酸热浆菌和HslV。次级结构标记为股(箭头)和螺旋(圆柱体)。
图2
图2
用同晶置换的相位计算电子密度,经过3倍平均后,在Thr-1周围以1.0σ等高线绘制,并与最终模型重叠。
图3
图3
HslV的球体模型显示了交错排列的两个堆叠的六聚环的十二聚体。
图4
图4
绘制的HslV的填充表示抓住(20). 沿着圆柱轴切开HslV,以显示水解室和结合的钙蛋白酶抑制剂分子。
图5
图5
HslV(红色)与嗜酸乳杆菌β-亚基(绿色)与结合钙蛋白酶抑制剂。次要结构图元将被标记。
图6
图6
将一个六聚环HslV(红色)与一个七聚环重叠嗜酸乳杆菌β-亚基(绿色)。
图7
图7
HslV堆叠六元环的子结构侧视图(上部)和七元环嗜酸乳杆菌(下部)分别是。红色亚基的方向相同。子单元间接触的拓扑结构是守恒的。

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