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.2023年1月6日;51(D1):D523-D531。
doi:10.1093/nar/gkac1052。

UniProt:2023年的通用蛋白质知识库

合作者

UniProt:2023年的通用蛋白质知识库

UniProt财团. 核酸研究. .

摘要

UniProt知识库的目的是为用户提供一组全面、高质量和可自由访问的蛋白质序列,并用功能信息进行注释。在本出版物中,我们描述了为适应不断增长的信息内容而对我们的数据处理管道和网站进行的增强。UniProtKB中的序列数量已超过2.27亿,我们正在努力为每个分类组包括一个参考蛋白质组。我们继续从文献中提取详细的注释,以更新或创建已审阅的条目,而未审阅的条目则由使用各种机器学习技术的自动化系统提供的注释进行补充。此外,科学界继续为他们感兴趣的UniProt条目提供出版物和注释。最后,我们描述一下我们的新网站(https://www.uniprot.org/),旨在增强我们的用户体验,并使我们的数据易于研究社区访问。该界面包括85%以上条目的AlphaFold结构访问以及蛋白质亚细胞定位的改进可视化。

PubMed免责声明

数字

图1
图1
(A类)过去10年UniProt数据库的增长以及(B类)参考蛋白质组的生长和分类分解。
图2。
图2。
UniProt众包活动统计。(A类)提交的累计数量、涵盖的独特出版物和蛋白质,以及选定版本的贡献者数量。2019_08版是社区提交出现的第一个版本,2022_03版是本手稿编写时的最新版本。(B类)由社区提交至少一份出版物的独特蛋白质条目的分类分布。(C类)按类别显示注释相对分布的框图。
图3
图3
(A类)搜索UniProt网站和(B类). 相同搜索结果的表视图。
图4。
图4。
UniProtKB条目CL18A_HUMAN(UniProtKB:A5D8T8)显示了嵌入的SwissBioPics图像:根据生物分类选择通用动物细胞(真后生动物)。它包含71个相互作用的位置,其中内质网、高尔基体、内体和分泌空间通过UniProt条目的注释突出显示。

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引用人

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