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2022年6月;59(6):3678-3689.
doi:10.1007/s12035-022-02789-4。 Epub 2022年4月2日。

肌萎缩侧索硬化症患者外周血白细胞中长非编码RNA的表达差异及其特征

附属公司

肌萎缩侧索硬化患者外周血白细胞长非编码RNA的表达差异及特征

余娇余等。 摩尔神经生物醇 2022年6月

摘要

肌萎缩侧索硬化症(ALS)是一种累及上下运动神经元的渐进性神经退行性疾病。不到10%的ALS患者被定义为家族性ALS,90%以上为散发性ALS(SALS)。根据现有数据库中描述的基因组信息,高达98%的人类基因组由非编码序列组成。近40%的长非编码RNA(lncRNAs)在大脑中特异性表达。我们认为lncRNAs表达的差异在神经退行性疾病中起着关键作用。我们通过微阵列从SALS患者的外周血白细胞中筛选了30个表达改变的lncRNA,并在SALS、帕金森病(PD)患者和健康对照(HC)的白细胞中验证了其中13个lncRNA。我们遵循生物信息学对共表达mRNA、转录因子和lncRNA进行功能富集分析,以进行功能预测。我们发现,在SALS患者中,lnc-DYRYK2-7:1、lnc-ABCA12-3:1和lnc-POTEM-4:7的表达降低,而在PD患者中,它们的表达增加或无变化。此外,在SALS和PD患者中,lnc-CNTN4-2:1和lnc-NR3C2-8:1的表达均降低。我们发现,XIST仅在男性SALS和PD患者中降低,而在女性SALS患者中没有降低,但在PD患者中按性别分组升高。我们还对在微阵列中显示差异表达的lncRNA进行了GO项富集和KEGG通路分析。我们发现,有很大一部分差异表达的lncRNA与各种信号通路和转录因子相关,这与其他临床发现一致。

关键词:肌萎缩侧索硬化;生物标记物;LncRNA;神经变性疾病。

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