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.2017年10月13日;68(17):4915-4927.
doi:10.1093/jxb/erx294。

过硫化蛋白质组揭示了硫化氢在拟南芥不同生物过程中对蛋白质功能的调节

附属公司

过硫化蛋白质组揭示了硫化氢在拟南芥不同生物过程中对蛋白质功能的调节

安吉丽斯·阿罗卡等。 J Exp机器人. .

摘要

硫化氢介导的信号通路调节哺乳动物和植物系统中的许多生理和病理生理过程。硫化氢发挥作用的分子机制涉及半胱氨酸残基的翻译后修饰,以形成过硫硫醇基序,这一过程称为蛋白质过硫化。我们开发了一种比较和定量蛋白质组分析方法,用于检测野生型拟南芥和L-CYSTEINE DESULFHYDRASE 1突变体叶片中的内源性过硫化蛋白。2015年鉴定的过硫化蛋白是从受控条件下生长的植物中分离出来的,因此,在基线条件下,至少5%的整个拟南芥蛋白质组可能会发生过硫化。生物信息学分析表明,过硫化半胱氨酸参与广泛的生物功能,调节重要的过程,如碳代谢、植物对非生物和生物胁迫的反应、植物生长和发育以及RNA翻译。两种遗传背景下的定量分析表明,蛋白质过硫化主要参与初级代谢途径,如三羧酸循环、糖酵解和卡尔文循环,表明这种蛋白质修饰是这些途径中的一个新的调节成分。

关键词:半胱氨酸;硫化氢;质谱;过硫化;翻译后修饰;蛋白质组学。

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数字

图1。
图1。
使用标记开关方法识别和量化拟南芥叶片中过硫化蛋白的程序示意图。
图2。
图2。
LC-MS/MS鉴定的30天生拟南芥野生型植物叶提取物中过硫化蛋白的功能分类。(A) 按生物过程分类的基因本体(GO)术语的功能分类。(B) 亚细胞定位功能分类。
图3。
图3。
植物糖酵解途径中的过硫化蛋白。红色方块代表过硫化蛋白质。胞浆、GapC1和GapC2、叶绿体、GapA1、GapA2和GapB以及甘油醛-3-磷酸脱氢酶的NADP依赖性异构体以蓝色突出显示。
图4。
图4。
过硫化定量调节蛋白质的功能特性。(A) 过硫化差异调节的蛋白质的功能分布设计1和野生型植物。(B) 用AgriGO进行单一富集分析,以确定与过硫化负调控蛋白质相关的富集基因本体设计1突变体与野生型植物中的过硫化模式的比较。方框颜色表示统计显著性水平:黄色,0.05;橙色,e−5;红色,e−9。
图5。
图5。
拟南芥植物中S-亚硝基化蛋白和过硫化蛋白的比较。(A) 野生型和gsnor1-3型突变体(Hu等。和野生型和设计1基因本体(GO)术语按生物过程分类的功能分类。

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