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比较研究
.1988年5月;164(1):265-74.
doi:10.1016/0042-6822(88)90644-7。

Ross River和O'Nyong-Nyong病毒的非结构蛋白nsP3和nsP4:序列及其与其他α病毒的比较

附属机构
比较研究

Ross River和O'Nyong-Nyong病毒的非结构蛋白nsP3和nsP4的序列及其与其他α病毒的比较

E G施特劳斯等。 病毒学. 1988年5月.

摘要

我们对两种α病毒(Ross River病毒和O'Nyong-Nyong病毒)的nsP3和nsP4区域进行了测序,以检查这些病毒在许多α病毒中是否存在nsP3与nsP4之间的蛋白石终止密码子。我们发现Ross River病毒在nsP3和nsP4之间有一个同相蛋白石终止密码子,而在O'Nyong-Nyong病毒中,该终止密码子被精氨酸密码子取代。先前的研究表明,另外两种α病毒,辛德比斯病毒和米德尔堡病毒,具有分离nsP3和nsP4的蛋白石终止密码子[E.G.Strauss,C.M.Rice和J.H.Strauss1983年,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 80,5271-5275],而塞姆利基森林病毒具有取代蛋白石密码子的精氨酸密码子[K.Takkinen(1986)],《核酸研究》第145667-5682]页。因此,在迄今为止所检测的五种α病毒中,三种具有蛋白石密码子,两种没有。nsP4的产生需要读入那些具有这种终止密码子的α病毒中的蛋白石密码子,终止密码子可能的功能是调节nsP4产生量。那么,没有终止密码子的α病毒是否使用其他机制来调节该基因的活性,这是一个悬而未决的问题。这五种α病毒的nsP4s高度保守,共有71-76%的氨基酸序列相似性,并且所有五种都包含在许多RNA病毒复制酶中发现的Gly-Asp-Asp基序。nsP3的保守程度稍低,在大多数蛋白质中共享52-73%的氨基酸序列相似性,但每个nsP3都具有134-246个未知功能氨基酸的非保守C末端结构域。

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