The nephronophthisis-related gene ift-139 is required for ciliogenesis in Caenorhabditis elegans

doi:10.1038/srep31544

.2016年8月12日6:31544。

doi:10.1038/srep31544。

秀丽隐杆线虫纤毛发生需要肾结核相关基因ift-139

Niwa Shinsuke¹

附属公司

PMID： 27515926
预防性维修识别码：项目经理4981862
内政部： 10.1038/s代表31544

秀丽隐杆线虫纤毛发生需要肾结核相关基因ift-139

Niwa Shinsuke. 科学代表. 2016.

.2016年8月12:6:31544。

doi:10.1038/srep31544。

作者

Niwa Shinsuke¹

隶属关系

¹日本宫城县仙台县敖包县阿拉木木阿扎奥巴6-3号东北大学跨学科科学前沿研究所和生命科学研究生院，邮编980-8578。

PMID： 27515926
预防性维修识别码：项目经理4981862
内政部： 10.1038/s代表31544

摘要

纤毛缺陷会导致一系列称为纤毛病的疾病。肾病综合征是一种纤毛病，是肾脏疾病最常见的遗传原因。在这里，我克隆并分析了秀丽隐杆线虫中与肾结核相关的基因ift-139。ift-139只在秀丽线虫纤毛神经元中表达。遗传和细胞分析表明，ift-139在逆行鞭毛内运输中发挥作用，是纤毛形成所必需的。导致纤毛病的同源点突变破坏了秀丽线虫ift-139的功能。ift-139是人类TTC21B的直系同源基因，已知其突变可导致肾结石12和短肋骨胸廓发育不良4。这些结果表明ift-139在进化上是保守的，是纤毛形成的基础。

PubMed免责声明

数字

图1。克隆和表征*如果-139。*
(一)TTC21B和IFT-139的比较。使用SMART算法预测域。TTC21B和IFT-139都包含多个TPR域。这两种蛋白质的C末端半部分预计有六个TRP结构域，同源性为55%。虽然IFT-139的N端半部分预计不包含TPR重复，但N端半的同源性为47%。(b)GFP信号在*如果-139*发起人。棒材，100μm。(**c、 d日**)IFT-139:：GFP的本地化在*如果-139*发起人。头部神经元(**c（c）**)、角联纤毛（c'）和相移神经元(d日)被照亮。（c'）是纤毛区域的缩放(**c（c）**). 箭头表示纤毛。棒材，5μm。(**e、（f）**)PHA神经元示意图*srg-13号机组*发起人(**e（电子）**)PHA神经元中的IFT-139:：GFP信号(**（f）**). 星号和箭头分别表示细胞体和纤毛。棒材，5μm。

**图2。分析*如果-139*突变体。**
(一)的示意图*ZK328。*1/*如果-139*基因组区域。数据库中预测了两种亚型。两种亚型的第一个外显子在*gk477型*.面板中放大的区域(b)显示。(b)使用能够扩增*如果-139*和*待定-1*注意，在中未检测到ift-139gk477型. (**c–g**)*mnIs17[osm-6p:：osm-6:：gfp]*与交叉重量和*如果-139（gk477）*蠕虫和PHA和PHB神经元中的GFP信号。显示野生型相粒纤毛形态的代表性图像(**c（c）**，c'），*如果-139（gk477）*相粒纤毛(d日，d’）和*如果-139（gk477）*表达*如果-139a*cDNA(**e（电子）**)和*如果-139b*cDNA(**（f）**). （c'，d'）表示(**c（c）**,d日). (克)显示救援实验结果的图表*与相比，p<0.01第139页.带Bonferroni校正的缺口试验。n=40条蠕虫。

**图3。总表型*如果-139*突变体。**
(**a–c**)将一条蠕虫放在OP50饲养细菌上并培养过夜。(**a、 b条**)野生型代表性形象(一)和*如果-139*(b). (**c（c）**)计算了相对运动面积。平均值±标准偏差（S.D.）*p<0.01，t检验，n=10。注意*如果-139（gk477）*与野生型相比，突变体在狭窄的区域内移动。棒材，1厘米(d日)总表型*第139页*将突变体与*野生型，osm-3*、和*dyf-5型*突变体。daf、dauer形成、dyf、染料填充和交配：雄性交配。wt表示表型与wt相当，-表示表型中的缺陷。(**e（电子）**)观察到对二乙酰的趋化作用，并按照材料和方法中的描述计算趋化指数。平均值±标准差n=10个实验*p<0.01，t检验。

**图4。*如果-139*与人类有关*TTC21B型*基因。**
*如果-139（gk477）*;*mnIs17[osm6p:：osm-6:：gfp]*(一)通过线虫的表达获救*如果-139*cDNA(b)，人类*TTC21B型*(**c（c）**)和线虫*如果-139*L810P突变(d日). 展示了代表性的照片。棒材，5μm。(**e（电子）**)显示救援实验结果的图表*与*如果-139*.带Bonferroni校正的卡方检验。n=40条蠕虫。

图5。遗传分析*如果-139。*
使用*17万卢比*标记。wt的代表性图像(一),*如果-139*(b),*klp-11型*(**c（c）**),*车牌-3*(d日),*ifta-1型*(**e（电子）**),*ift-139；ifta-1型*(**（f）**),*如果-139；klp-11型*(克). 棒材，5μm。(小时)纤毛长度被测量并显示为条形图*p<0.05，不另作说明，p>0.05。单向方差分析。n=28。

**图6。IFT139在相粒纤毛中的运动性。**
(一)显示纤毛中段和远端*指示过渡区。(b)Kymography显示IFT-139:：GFP在相粒纤毛中的运动。M和D分别显示了中段和远端的波形图。M’和D’表示M和D条的轨迹，5 s（y轴）和1μM（x轴）。请看补充电影S1。(**c（c）**)顺行运输的运动参数总结。作为*如果-139（gk477）*表达IFT-139（L810P）的突变体没有正常的纤毛（图4d），运动性无法测量。n=150个颗粒。请注意，IFT-139:：GFP已移入重量和*如果-139（gk477）*以类似的方式。IFT-139（L810P）：：GFP搬入重量蠕虫，但无法拯救*ift-139（gk477）。*(d日)逆行运输的运动参数总结。n=60个粒子。

请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

全生物体发育表达谱鉴定RAB-28是一种新的纤毛GTPase，与BBSome和鞭毛内转运相关。
Jensen VL、Carter S、Sanders AA、Li C、Kennedy J、Timbers TA、Cai J、Scheidel N、Kennedy BN、Morin RD、Leroux MR、Blacque OE。 Jensen VL等人。《公共科学图书馆·遗传学》。2016年12月8日；12（12）：e1006469。doi:10.1371/journal.pgen.1006469。eCollection 2016年12月。《公共科学图书馆·遗传学》。2016 PMID：27930654 免费PMC文章。
主动转运和扩散屏障将Joubert综合征相关的ARL13B/ARL-13限制为类Inv睫状膜亚结构域。
Cevik S、Sanders AA、Van Wijk E、Boldt K、Clarke L、Van Reeuwijk J、Hori Y、Horn N、Hetterschijt L、Wdowicz A、Mullins A、Kida K、Kaplan OI、Van Beersum SE、Man Wu K、Letteboer SJ、Mans DA、Katada T、Kontani K、Ueffing M、Roepman R、Kremer H、Blacque OE。 Cevik S等人。《公共科学图书馆·遗传学》。2013;9（12）：e1003977。doi:10.1371/journal.pgen.1003977。Epub 2013年12月5日。《公共科学图书馆·遗传学》。2013 PMID：24339792 免费PMC文章。
秀丽隐杆线虫DYF-2是人类WDR19的直系同源物，是感觉纤毛鞭毛内运输机制的组成部分。
Efimenko E、Blacque OE、Ou G、Haycraft CJ、Yoder BK、Scholey JM、Leroux MR、Swoboda P。 Efimenko E等人。分子生物学细胞。2006年11月；17(11):4801-11. doi:10.1091/mbc.e06-04-0260。Epub 2006年9月6日。分子生物学细胞。2006 PMID：16957054 免费PMC文章。
秀丽隐杆线虫神经元的鞭毛内运输马达。
Scholey JM、Ou G、Snow J、Gunnarson A。 Scholey JM等人。生物化学Soc Trans。2004年11月；32（第5部分）：682-4。doi:10.1042/BST0320682。生物化学Soc Trans。2004 PMID：15493987 审查。
对鞭毛内运输的健康理解。
斯洛博达RD。斯洛博达路。细胞运动细胞骨架。2002年5月；52(1):1-8. doi:10.1002/cm.10035。细胞运动细胞骨架。2002 PMID：11977078 审查。

查看所有类似文章

引用人

肺纤维化中形态完整的气道具有异常蛋白质组。
Herrera JA、Dingle LA、Monetero MA、Venkateswaran RV、Blaikley JF、Granato F、Pearson S、Lawless C、Thornton DJ。 Herrera JA等人。 Resir Res.2023年4月1日；24(1):99. doi:10.1186/s12931-023-02400-x。 2023年Resir Res。 PMID：37005656 免费PMC文章。
综合建模揭示了鞭毛内转运A（IFT-A）复合体的分子结构。
McCafferty CL、Papoulas O、Jordan MA、Hoogerbrugge G、Nichols C、Pigino G、Taylor DW、Wallingford JB、Marcotte EM。 McCafferty CL等人。埃利夫。2022年11月8日；11:e81977。doi:10.7554/eLife.81977。埃利夫。2022 PMID：36346217 免费PMC文章。
走错了路：遗传性视网膜营养不良患者睫状体运输的改变。
Sánchez-Bellver L、Toulis V、Marfany G。 Sánchez-Bellver L等人。前细胞发育生物学。2021年3月5日；9:623734. doi:10.3389/fcell.2021.623734。eCollection 2021年。前细胞发育生物学。2021 PMID：33748110 免费PMC文章。审查。
疾病建模：了解人类遗传性肾脏疾病的发病机制。
Molinari E，塞耶JA。 Molinari E等人。《美国肾脏病临床杂志》。2020年6月8日；15(6):855-872. doi:10.2215/CJN.08890719。Epub 2020年3月5日。《美国肾脏病临床杂志》。2020 PMID：32139361 免费PMC文章。审查。
Bergmann胶质细胞需要Ttc21b才能进行适当的颗粒细胞径向迁移。
驾驶员AM、Shumrick C、Stottmann RW。驾驶员AM等。开发生物学杂志。2017年12月19日；5(4):18. doi:10.3390/jdb5040018。开发生物学杂志。2017 PMID：29615573 免费PMC文章。

查看所有“被引用”文章

工具书类

1. Rosenbaum J.L.和Witman G.B.鞭毛内转运。Nat Rev Mol Cell Biol 3，813–825，doi:10.1038/nrm952（2002）。-内政部-公共医学
1. 石川浩（Ishikawa H.&Marshall W.F.Ciliogenesis）：构建细胞的天线。Nat Rev Mol Cell Biol 12222-234，doi:10.1038/nrm3085（2011）。-内政部-公共医学
1. Scholey J.M.Cilium组件：通过驱动蛋白-2动力列车输送微管蛋白。Curr Biol 23，R956–R959，doi:10.1016/j.cub.2013.09.032（2013）。-内政部-公共医学
1. Jin H.等人…保守的Bardet-Biedl综合征蛋白组装了一层将膜蛋白运输到纤毛的外套。细胞1411208–1219，doi:10.1016/j.Cell.2010.05.015（2010）。-内政部-项目管理咨询公司-公共医学
1. Nachury M.V.等人…BBS蛋白的核心复合物与GTPase Rab8合作促进睫状膜的生物发生。细胞1291201-1213，doi:10.1016/j.Cell.2007.03.053（2007）。-内政部-公共医学

出版物类型

行动
行动

MeSH术语

行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动
行动

物质

行动

赠款和资金

P40 OD010440/OD/NIH HHS/美国

LinkOut-更多资源

[1] Rosenbaum J.L.和Witman G.B.鞭毛内转运。Nat Rev Mol Cell Biol 3，813–825，doi:10.1038/nrm952（2002）。-内政部-公共医学

[2] Rosenbaum J.L.和Witman G.B.鞭毛内转运。Nat Rev Mol Cell Biol 3，813–825，doi:10.1038/nrm952（2002）。-内政部-公共医学

[3] 石川浩（Ishikawa H.&Marshall W.F.Ciliogenesis）：构建细胞的天线。Nat Rev Mol Cell Biol 12222-234，doi:10.1038/nrm3085（2011）。-内政部-公共医学

[4] 石川浩（Ishikawa H.&Marshall W.F.Ciliogenesis）：构建细胞的天线。Nat Rev Mol Cell Biol 12222-234，doi:10.1038/nrm3085（2011）。-内政部-公共医学

[5] Scholey J.M.Cilium组件：通过驱动蛋白-2动力列车输送微管蛋白。Curr Biol 23，R956–R959，doi:10.1016/j.cub.2013.09.032（2013）。-内政部-公共医学

[6] Scholey J.M.Cilium组件：通过驱动蛋白-2动力列车输送微管蛋白。Curr Biol 23，R956–R959，doi:10.1016/j.cub.2013.09.032（2013）。-内政部-公共医学

[7] Jin H.等人…保守的Bardet-Biedl综合征蛋白组装了一层将膜蛋白运输到纤毛的外套。细胞1411208–1219，doi:10.1016/j.Cell.2010.05.015（2010）。-内政部-项目管理咨询公司-公共医学

[8] Jin H.等人…保守的Bardet-Biedl综合征蛋白组装了一层将膜蛋白运输到纤毛的外套。细胞1411208–1219，doi:10.1016/j.Cell.2010.05.015（2010）。-内政部-项目管理咨询公司-公共医学

[9] Nachury M.V.等人…BBS蛋白的核心复合物与GTPase Rab8合作促进睫状膜的生物发生。细胞1291201-1213，doi:10.1016/j.Cell.2007.03.053（2007）。-内政部-公共医学

[10] Nachury M.V.等人…BBS蛋白的核心复合物与GTPase Rab8合作促进睫状膜的生物发生。细胞1291201-1213，doi:10.1016/j.Cell.2007.03.053（2007）。-内政部-公共医学

将引文保存到文件

电子邮件引文

添加到集合

添加到我的书目

您保存的搜索

为外部引文管理软件创建文件

您的RSS源

秀丽隐杆线虫纤毛发生需要肾结核相关基因ift-139

隶属关系

秀丽隐杆线虫纤毛发生需要肾结核相关基因ift-139

作者

隶属关系

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

其他文献来源

医疗

研究材料

摘要

数字

类似文章

引用人

工具书类

出版物类型

MeSH术语

物质

相关信息

赠款和资金

LinkOut-更多资源

全文源

其他文献来源

医疗

研究材料