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。2015年6月；37(3):9796.
doi:10.1007/s11357-015-9796-7。 Epub 2015年6月3日。

年轻和老年小鼠正常和再生肝脏的整体基因表达谱

莫妮卡·皮比里 1, 皮亚·苏拉斯, 维拉·皮拉·利奥尼, 安德烈亚·佩拉, 玛塔·安娜·科瓦利克, 安吉拉·科德拉, 帕斯奎尔·萨格塞, 乔瓦尼·纳萨, 玛丽亚·拉沃
附属公司

年轻和老年小鼠正常和再生肝脏的整体基因表达谱

莫妮卡·皮比里等。 年龄（多德）。 2015年6月。

摘要

在老年啮齿动物和人类中，肝脏在2/3部分肝切除术（PH）后再生和调整大小的能力受损。在此，我们通过微阵列分析研究了未经治疗的年轻和老年小鼠肝脏基因的表达模式以及PH后基因表达谱的差异。在10237个可检测到表达的信使RNA中，只有108个在两组之间的基因表达水平出现了2倍以上的改变。这些基因参与炎症和免疫反应、外源性物质以及脂质和葡萄糖代谢。为了确定引起不同再生反应的基因，在手术后的不同时间间隔处死10周龄和18个月龄的PH小鼠。结果表明，2463个转录本在PH后两组之间的表达存在显著差异。然而，尽管老年小鼠的肝再生受损，但两组的细胞周期基因都发生了类似的改变，唯一的例外是cyclin D1基因在幼鼠PH后很快上调，但在老年动物中大多下调。令人惊讶的是，在年轻的肝切除小鼠中，Yap信使RNA（mRNA）的表达没有显著增强，蛋白质的表达基本上反映了进入细胞周期的进展，其mRNA和蛋白质水平在老龄动物的肝脏中显著增加。此外，还观察到尺寸调节蛋白Yes-associated protein（YAP）的年龄相关表达的显著变化。出乎意料的是，在年轻的肝切除小鼠中，Yap mRNA表达没有显著增强，蛋白表达基本上反映了进入细胞周期的进展，其mRNA和蛋白水平在老龄动物的肝脏中显著增加。此外，当对有丝分裂原诱导的肝脏肿大进行PH治疗时，与接受PH治疗的动物相比，早期恢复原肝质量只会导致YAP下调，同时cyclin D1上调。我们的数据表明，YAP激活是一种大小依赖的体内平衡机制，不一定反映细胞周期的进展。

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数字

图1
图1
老年和年轻小鼠的基因表达谱。一散点图显示老年与年轻小鼠肝脏中所有表达转录物的比较。蓝色圆点表示两组之间在折叠差异截止点2以上差异表达的转录本红线。b条热图显示老年小鼠与年轻小鼠肝脏之间差异表达的转录物。c（c）比较年轻和老年小鼠肝脏获得的解除管制转录物的功能注释分析。转录本按照生物过程分类(上部面板)和InterPro(下部面板)使用FIDEA生物信息学工具的本体分类
图2
图2
老年和年轻肝脏PH后肝细胞增殖。一显示2/3 PH后老年和年轻小鼠肝细胞中BrdU掺入的典型显微照片（苏木精X200复染切片）。小鼠接受PH处理，48小时后处死。所有小鼠均在饮用水中给予BrdU（1 mg/ml），直至处死。一氧化碳控制。b条老年和年轻小鼠肝细胞的标记指数受到2/3 PH的影响。每个肝脏至少有2000个肝细胞核被计分。LI表达为BrdU阳性肝细胞核/100个细胞核。结果以每组4-5只小鼠的平均值±SE表示**第页 < 0.001;NS公司不重要
图3
图3
PH后老年和年轻小鼠的基因表达谱。热图显示老年小鼠PH后至少一个时间点、3、6、12、24和36小时内调节的特定转录物(一)或幼鼠(b条). 成绩单增长>2倍(红色)或减少>2倍(绿色)显示与0时间点的比较
图4
图4
老年和年轻肝脏PH后的细胞周期相关基因修饰。一用qRT-PCR和基因表达芯片检测老年和年轻小鼠PH后mRNA的表达。与年龄匹配的对照组相比，基因表达被报告为相对定量（RQ）或倍差（FD）。b条细胞周期相关蛋白的Western blot分析。在2/3 PH后12、24和36 h处死老年和年轻小鼠。制备总提取物（100至150 mg/lane），并按照“材料和方法”一节所述进行西方分析。通过用考马斯蓝染色凝胶并使用抗肌动蛋白抗体作为负荷控制，确认适当的负荷。每个车道代表一个三个肝脏的池。一氧化碳控制
图5
图5
PH后老肝和幼肝中YAP的表达。一微阵列分析是的mRNA。在PH后测定老年和年轻小鼠的mRNA表达。基因表达是相对于年龄匹配的对照组的倍差。b条YAP和磷酸化YAP蛋白的Western blot分析。在2/3 PH后12、24和36 h处死老年和年轻小鼠。按照“材料和方法”一节中的描述制备总提取物（100至150 mg/lane）。通过用考马斯蓝染色凝胶并使用抗肌动蛋白抗体作为负荷控制，确认适当的负荷。每个l电子设备代表一个三个肝脏的池。一氧化碳控制。c（c）Western blot分析PH小鼠肝脏中的细胞周期蛋白D1、PCNA、YAP和磷酸-YAP（分别为TCPBOP和PH）。如“材料和方法”一节所述，用丝裂原TCP处理幼鼠3天后，将其置于PH值下。在PH后72小时处死动物。从肝脏中制备总提取物（100至150 mg/车道），并按照“材料和方法”一节所述进行西方分析。通过用考马斯蓝染色凝胶并使用抗肌动蛋白抗体作为负荷控制，确认适当的负荷。每个车道代表一个三个肝脏的池。一氧化碳控制。d日TCP+PH或PH肝细胞核YAP的Western blot分析。制备YAP的核提取物（100至150 mg/车道），并按照“材料和方法”一节所述进行西方分析。通过用考马斯蓝染色凝胶并使用抗白蛋白抗体作为负荷控制，确认适当的负荷。每个车道代表一个三个肝脏的池。一氧化碳控制
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