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元分析
.2015年3月3日;84(9):918-26.
doi:10.1212/WNL.0000000001309。 Epub 2015年2月4日。

COL4A1/COL4A2的常见变异与散发性脑小血管疾病相关

克里斯蒂娜·兰尼科梅 1盖尔·戴维斯 1皮帕·A·汤姆森 1史蒂夫·贝文 1威廉·J·德万 1吉多·J·法尔科内 1马修·特雷勒 1克里斯托弗·安德森 1托马斯·W·K·巴蒂 1法里德·拉德马内什 1兰扬·德卡 1杰西卡·G·吴 1丽莎·马丁 1Jordi Jimenez-Conde公司 1玛格迪·塞利姆 1德文·L·布朗 1斯科特·西利曼 1切尔西S基德威尔 1琼·蒙塔纳 1卡尔·德兰菲尔德 1阿格涅斯卡·斯洛维克 1比约恩·汉森 1阿恩·林格伦 1詹姆斯·梅斯基亚 1Myriam Fornage公司 1约书亚·C·比斯 1圣埃芬妮·德贝特(Stéphanie Debette) 1穆罕默德·阿伊克拉姆 1威尔·T·朗斯特莱斯 1雷霍德·施密特(Reinhold Schmidt) 1凯西·R·张 1琼阳 1潘卡杰·夏尔马 1史蒂文·基特纳 1布拉克斯顿·D·米切尔 1伊丽莎白·霍利迪 1克里斯托弗·列维 1约翰·阿提亚 1彼得·罗思韦尔 1黛博拉·普尔 1乔治·邦科拉利奥(Giorgio B Boncoraglio) 1布鲁斯·M·普萨蒂 1雷纳·马利克 1纳塔利娅·罗斯特 1Bradford B Worrall公司 1马丁·迪奇根斯 1汤姆·范·阿特梅尔 1丹尼尔·吴 1休·S·马库斯 1苏达·瑟哈德里 1乔纳森·罗森德 1凯蒂·L·M·苏德洛 2; METASTROKE财团; CHARGE WMH集团; ISGC ICH GWAS研究合作; WMH在缺血性卒中GWAS研究中的合作; 国际中风遗传学联合会
附属公司
元分析

COL4A1/COL4A2的常见变异与散发性脑小血管疾病相关

克里斯蒂娜·兰尼科梅等。 神经病学. .

摘要

目标:我们假设胶原基因COL4A1/COL4A2的常见变异与散发性脑小血管疾病有关。

方法:我们对欧洲血统个体的现有基因型数据进行了荟萃分析,以确定COL4A1/COL4A2基因组区域1070个常见单核苷酸多态性(SNP)与以下因素的关联:脑出血及其亚型(深部、叶部)(1545例,1485例对照);缺血性卒中及其亚型(心源性栓塞、大血管疾病、腔隙性)(12389例,62004例对照);和白质高信号(2733例缺血性卒中患者和9361例基于人群的队列脑MRI数据)。我们计算了一个统计显著性阈值,用于解释SNP之间的多重检验和连锁不平衡(p<0.000084)。

结果:COL4A2中的三个内含子SNP与深部脑出血显著相关(导联SNP比值比[OR]1.29,95%可信区间[CI]1.14-1.46,p=0.00003;SNP之间r(2)>0.9)。尽管与深部脑出血相关的SNP在与腔隙性缺血性卒中(SNP OR 1.10导联,95%CI 1.03-1.18,p=0.0073)和有症状的缺血性卒中患者白质高密度容积(SNP OR1.07导联,95%CI 1.01-1.13,p=0.016)相关方面没有达到我们的显著性阈值,联想的方向是相同的。在基于人群的研究中,没有令人信服的证据表明白质高信号与非小血管疾病脑血管表型有关。

结论:我们的结果表明,COL4A2基因的常见变异与有症状的小血管疾病,尤其是深部脑出血之间存在关联。这些发现值得复制研究,包括非欧洲血统的种族群体。

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数字

图1
图1。深度ICH荟萃分析的区域关联图
点标记单个SNP;y轴:第页每个SNP与深部ICH的相关性值;x轴:SNP的位置。最显著相关的SNP显示为紫色;其他SNP的颜色取决于与该领先SNP的连锁不平衡(参见第页2图上的颜色编码)。重组:减数分裂期间两条同源染色体之间的DNA片段交换,导致后代中遗传物质的新组合。重组率:以单位物理距离的交换频率(centimorgan[cM]/mega碱基对[Mb])衡量。cM:连锁单位,指两个基因位点之间的距离,由它们之间发生重组的频率决定。如果在1%的减数分裂中观察到两个位点之间的重组,则称这两个位点相距1 cM。Mb:核酸的长度单位,等于100万个碱基对。ICH=脑出血;SNP=单核苷酸多态性。
图2
图2。3个SNP之间的关联与所有表型的深部ICH显著相关
图中显示了所有队列的合并优势比。大脑小血管疾病表型的显著或暗示关联以红色显示。在WMH人群队列中没有rs9521733的数据。CE=心脏栓塞;CI=置信区间;ICH=脑出血;IS=缺血性中风;LVD=大血管疾病;SNP=单核苷酸多态性;WMH=白质高强度。
图3
图3。深部脑出血荟萃分析中各组间显著单核苷酸多态性的相关性
异质性:rs9521732:χ22数据流= 0.09,第页= 0.9563,2= 0%; rs9521733:χ22数据流= 0.02,第页= 0.9903,2= 0%; rs9515199:χ22数据流= 0.08,第页= 0.9607,2= 0%. CI=置信区间;GERFHS=出血性卒中的遗传和环境危险因素;GOCHA=脑出血抗凝遗传学;国际中风遗传学联合会。

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