An NTP-binding motif is the most conserved sequence in a highly diverged monophyletic group of proteins involved in positive strand RNA viral replication

doi:10.1007/BF02102483

比较研究

.1989年3月；28(3):256-68.

doi:10.1007/BF02102483。

NTP结合基序是参与正链RNA病毒复制的高度分化的单系蛋白质组中最保守的序列

A E戈巴伦亚¹, V M布林诺夫, A P Donchenko先生, E V Koonin公司

附属公司

PMID： 2522556
预防性维修识别码：项目管理委员会7087505
内政部： 2007年10月10日/BF02102483

比较研究

NTP结合基序是参与正链RNA病毒复制的高度分化的单系蛋白质组中最保守的序列

A E戈巴伦亚等。 J摩尔进化. 1989年3月.

.1989年3月；28(3):256-68.

doi:10.1007/BF02102483。

作者

A E戈巴伦亚¹, V M布林诺夫, A P Donchenko先生, E V Koonin公司

附属

¹莫斯科地区苏联医学科学院脊髓灰质炎研究所。

PMID： 2522556
预防性维修识别码：第7087505页
内政部： 2007年10月10日/BF02102483

摘要

NTP-motif是一个先前被证明具有许多NTP使用酶特征的一致序列，在几组阳性RNA病毒的非结构蛋白中被鉴定。这些病毒包括感染动物的小核糖核酸病毒、α病毒和冠状病毒，以及植物的科莫病毒、马铃薯病毒、烟草病毒、三核糖核酸、霍尔迪病毒和呋喃病毒，共计21种病毒。已经证明，含NTP-motif的病毒蛋白构成三个不同的家族，每个家族中的序列在统计学上高度相似。家族之间的相似性更低，但仍然有效。已经生成了一个整体线形，其中包括几个高度保守的层序延伸。后者中最突出的两个包含NTP-motif的所谓“A”和“B”位点，在这些序列中观察到五个不变氨基酸残基中的四个。这些观察结果，加上病毒多结构域蛋白中各蛋白（结构域）所占位置的比较分析结果，表明阳性链RNA病毒的所有含有NTP基序的蛋白都是同源的，构成了一个高度分化的单系群。在这一组中，NTP-motif的“A”和“B”位点是最保守的序列，通过推断，应该在蛋白质的功能中发挥主要作用。有人提出假设，所有这些蛋白都具有NTP结合能力，可能还具有NTP酶活性，在病毒RNA复制中发挥一些NTP依赖性功能。强调了系统发育分析对评估蛋白质中NTP-motif（以及此类序列基序）发生的重要性的重要性。

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