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.2013年4月;46(2):264-70.
doi:10.1007/s11262-012-0844-4。 Epub 2012年11月10日。

从中国病猪中分离的一株致透镜新城疫病毒HX01的基因组特征

附属公司

从中国病猪中分离的一株致透镜新城疫病毒HX01的基因组特征

陈胜利等。 病毒基因. 2013年4月.

摘要

本文描述了HX01的全基因组序列,HX01是从猪瘟暴发中分离的新城疫病毒(NDV)。基因组长15186 nt,由6个基因组成,顺序为3'-NP-P-M-F-HN-L-5'。该基因组与旧的NDV基因型(I-IV)长度相同,而新的NDV病毒基因型(V-IX)长度为15192 nt。与参考NDV株的基因组序列相比,HX01基因组与其他NDV株基因组高度相似。然而,HX01中发现了HN基因的一些独特特征。HX01在融合蛋白裂解位点具有(112)G-R-Q-G-R-L(117)基序,这是典型的透镜菌。基于平均死亡时间和脑内致病性指数的致病性测试也揭示了分离物的致肠特性。基于F基因可变区(nt 47-420)的系统发育分析表明,HX01在Ⅱ类NDV中属于Ⅱ型。从遗传学角度来看,HX01与基于单基因或全基因组的La Sota疫苗株有很高的相似性,但与中国大陆禽类和水禽中流行的VIId NDV基因型有很大不同。

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