A head and neck cancer tumor response-specific gene signature for cisplatin, 5-fluorouracil induction chemotherapy fails with added taxanes

doi:10.1371/journal.pone.0047170

临床试验

.2012;7（10）：e47170。

doi:10.1371/journal.pone.0047170。 Epub 2012年10月9日。

顺铂、5-氟尿嘧啶诱导化疗在添加紫杉烷后失败的头颈部肿瘤特异性基因签名

塞琳·托姆基维茨¹, 圣埃芬·汉斯, 玛丽·赫莱娜·穆切利, 尼古拉斯·阿吉尔, 埃尔维·德拉克罗瓦, 莱蒂蒂亚·马里萨, 丹尼尔·布拉斯努, 劳伦斯·P·阿格贝克, 塞西尔·巴杜阿尔, 罗伯特·巴罗基, 马丁娜·阿格贝克

附属公司

PMID： 23056603
预防性维修识别码：项目经理3467249
内政部： 10.1371/journal.pone.0047170

临床试验

顺铂、5-氟尿嘧啶诱导化疗在添加紫杉烷后失败的头颈部肿瘤特异性基因签名

塞琳·托姆基维茨等。公共科学图书馆一号. 2012.

.2012;7（10）：e47170。

doi:10.1371/journal.pone.0047170。 Epub 2012年10月9日。

作者

塞琳·托姆基维茨¹, 圣埃芬·汉斯, 玛丽·海莱恩·穆奇利, 尼古拉斯·阿吉尔, 埃尔维·德拉克罗瓦, 莱蒂蒂亚·马里萨, 丹尼尔·布拉斯努, 劳伦斯·P·阿格贝克, 塞西尔·巴杜阿尔, 罗伯特·巴罗基, 马丁娜·阿格贝克

附属

¹INSERM，UMR-S，圣佩雷斯大学中心，法国巴黎。

PMID： 23056603
预防性维修识别码：项目经理3467249
内政部： 10.1371/journal.pone.0047170

摘要

背景：预测哪些晚期头颈部鳞状细胞癌患者在诱导化疗后肿瘤大小不会缩小是一个重大的临床挑战，以避免无效化疗的毒副作用和延迟制定其他治疗方案。此外，我们有兴趣了解当在方案中添加其他化疗药物时，用于识别对特定诱导化疗无反应的肿瘤患者的基因签名在多大程度上适用。

方法/主要发现：为了确定预测顺铂/5-氟尿嘧啶（PF）或PF和紫杉烷诱导肿瘤耐药的基因，我们使用全基因组微阵列和定量逆转录聚合酶链反应（TLDA）卡分析了患者肿瘤活检。遗漏一项交叉验证程序允许评估预测工具。十基因微阵列特征正确地将12/13个有应答者和7/10个无应答者分类为PF（特异性92%，准确性82.6%）。患者的TLDA分析（使用相同的分类器）正确分类了12/12应答者和8/10无应答者（100%特异性，90.9%准确率）。此外，TLDA分析正确预测了5名新患者的反应，总的来说，12/12名有反应者和13/15名无反应者（特异性100%，准确性92.6%）。构成特征的基因的蛋白质产物与27个其他蛋白质物理关联，参与调节基因表达，构成相互作用网络。相反，基于TLDA的预测（具有相同的基因特征）PF和两种紫杉烷中的任何一种诱导反应都很差（特异性0%，准确性25%，特异性33.3%，准确性25%）。

结论/意义：将基于微阵列的基因签名成功转移到独立的、基于PCR的技术表明，基于TLDA的签名可能是一种有用的基于医院的技术，用于确定治疗方案。尽管对PF诱导的肿瘤反应具有高度特异性，但当添加紫杉烷时，基因签名是不成功的。结果说明了开发“个性化医疗”的微妙之处。

PubMed免责声明

利益冲突声明

竞争利益：提交人声明，不存在相互竞争的利益。

数字

**图1。NR和CCR个体活检的代表性HES、p16和HPV染色。**
HES-NR和HES-CCR分别对应于代表性无应答者和完全临床应答者个体的苏木精-伊红-藏红染色，IHC-p16和HIS-致癌HPV对应于p16抗原的代表性阳性免疫组化（棕色染色）和杂交就地分别用于致癌HPV DNA（蓝色斑点核染色）。条形图表示上部面板为40微米，下部面板为20微米。

**图2。微阵列（MA）和TLDA（TLDA）基因表达数据的三维多维缩放（使用欧几里德距离）。**
10基因分类器清楚地分离出NR（蓝色球体）和CCR（红色球体）组的成员。82-83%的可变性包含在前三个维度中。

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这项工作得到了CNRS（国家科学研究中心）、INSERM（国家医学研究所）、巴黎公共卫生协会（CRC03017）、巴黎笛卡尔大学的支持。资助者在研究设计、数据收集和分析、出版决定或手稿准备方面没有任何作用。

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