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元分析
.2012年11月;11(11):951-62.
doi:10.1016/S1474-4422(12)70234-X。 Epub 2012年10月5日。

缺血性卒中及其亚型的遗传危险因素(METASTROKE合作):全基因组关联研究的荟萃分析

马修·特雷勒 1马丁·法雷尔伊丽莎白·霍利迪凯西·萨德洛杰玛·C·霍普韦尔程玉庆Myriam Fornage公司M Arfan Ikram先生雷纳·马利克史蒂夫·贝文Unnur Thorsteinsdottir公司迈克·A·纳尔Wt Longstreth公司凯里·L·威金斯苏娜娜·雅达夫尤金尼奥·帕拉蒂安妮塔·L·德斯特法诺Bradford B Worrall公司史蒂文·基特纳穆罕默德·萨利姆·汗亚历克斯·P·雷纳安娜·赫尔加多蒂尔塞凡妮娅·阿切特伯格以色列费尔南德斯·卡迪纳斯谢琳·阿布德雷霍德·施密特(Reinhold Schmidt)沃尔特魏敏晨伯恩德·林格尔斯坦马丁·奥唐纳Weang Kee Ho公司乔安娜·佩拉罗宾·莱蒙斯Bo Norrving公司彼得·希金斯玛丽安·本恩米歇尔·塞尔格雷戈·库伦巴努默亚历山大·S·F·多尼Astrid M Vicente公司侯赛因·德拉瓦兰亚历·阿尔格拉盖尔·戴维斯索菲亚·奥利维拉科林·N·A·帕尔默伊恩·德利海伦娜·施密特马西莫·潘多尔夫琼·蒙塔纳卡拉·卡蒂保罗·德巴克Konstantinos Kostulas公司何塞·M·费罗娜塔莉·范·祖达姆埃纳尔·瓦尔迪马斯森博尔盖·诺德斯加德阿恩·林格伦文森特·蒂斯阿格涅斯卡·斯洛维克丹麦Saleheen纪尧姆·帕雷克劳斯·伯杰古德马尔·索莱夫森; 澳大利亚中风遗传学合作组织,威康信托病例控制联盟2(WTCCC2); 阿尔伯特·霍夫曼托马斯·莫斯利布拉克斯顿·D·米切尔凯伦·福瑞罗勃·克拉克克里斯托弗·列维苏达·瑟哈德里安德烈亚斯·格施温特纳乔治·邦科拉格里奥潘卡杰·夏尔马约书亚·C·比斯索维格·格雷塔斯多蒂布鲁斯·M·普萨蒂彼得·罗思韦尔乔纳森·罗桑詹姆斯·梅西娅凯里·斯蒂芬森马丁·迪奇根斯休·S·马库斯; 国际中风遗传学联合会
附属公司
元分析

缺血性卒中及其亚型的遗传危险因素(METASTROKE合作):全基因组关联研究的荟萃分析

马修·特雷勒等。 柳叶刀神经病学. 2012年11月.

勘误表in

  • 更正。
    [未列出作者] [未列出作者] 柳叶刀神经病学。2015年8月;14(8):788. doi:10.1016/S1474-4422(15)00155-6。 柳叶刀神经病学。2015 PMID:26194924 免费PMC文章。 没有可用的摘要。

摘要

背景:各种全基因组关联研究(GWAS)已在缺血性卒中中进行,确定了一些与疾病相关的基因座,但样本量为3500例或更少。我们建立了METASTROKE合作,目的是通过对缺血性卒中及其亚型的GWAS数据集进行荟萃分析,验证先前GWAS的关联性,并确定新的遗传关联。

方法:我们对15个缺血性卒中队列的数据进行了荟萃分析,共有12389名缺血性卒中患者和62004名对照组,均为欧洲血统。对于在METASTROKE中达到全基因组意义的关联,我们做了进一步的分析,以每个关联区域的领先单核苷酸多态性为条件。在13 347例患者和29 083例对照组中复制了新的暗示信号。

调查结果:我们验证了先前与PITX2附近的心脏栓塞性中风(p=2.8×10(-16))和ZFHX3附近的心脏栓塞性中风(p=2.28×10(-8))以及9p21基因座的大血管中风(p=3.22×10(-5))和HDAC9(p=2.03×10(-12))的相关性。此外,我们验证了所有关联都是特定于子类型的。对三个区域(PITX2、ZFHX3和HDAC9)的条件分析表明,每个区域中的所有信号都可归因于一个风险单倍型。我们还在p<5×10(-6)处鉴定了12个潜在的新位点。然而,我们无法在复制队列中复制这些新的关联。

解释:我们的结果表明,尽管与对照组相比,缺血性卒中患者可以检测到遗传变异,但我们能够确认的所有关联都是特定于卒中亚型的。这一发现有两个含义。首先,为了使缺血性中风的遗传研究取得最大成功,需要进行详细的中风亚型划分。其次,不同的遗传病理生理机制似乎与不同的中风亚型有关。

基金:Wellcome Trust、英国医学研究委员会(MRC)、澳大利亚国家和医学健康研究委员会、国家卫生研究院(NIH),包括国家心脏、肺和血液研究所(NHLBI)、国家老龄化研究所(NIA)、国家人类基因组研究院(NHGRI)、,以及国家神经疾病和中风研究所(NINDS)。

PubMed免责声明

数字

图1
图1
METASTROKE分析流程图GWAS=全基因组关联研究。SNP=单核苷酸多态性。
图2
图2
曼哈顿原木图10(p) 针对主要分析的基因组位置(A)所有缺血性中风。(B) 大血管疾病。(C) 心源性栓塞。(D) 小血管疾病。四种主要分析的基因组位置的全基因组荟萃分析关联结果。
图3
图3
铅SNP SNP=单核苷酸多态性条件作用前后条件分析区域图。在meta分析发现样本中发现亚型的条件分析中,研究了基因座周围的关联信号图。SNPs根据其相关性进行着色(r2)带有标记的顶部SNP,在该区域具有最小的p值。根据HapMap数据估计的精细重组率用红色标记,下面用水平蓝线标记基因。蓝色横线上的箭头表示转录方向,矩形是外显子。(A、C、E)来自发现荟萃分析的区域。(B,D,F)在对来自该区域的铅SNP进行调节后,与A,C,E的区域相同。

中的注释

  • 从基因到中风亚型。
    阿莫耶尔P。 阿莫耶尔P。 柳叶刀神经病学。2012年11月;11(11):931-3. doi:10.1016/S1474-4422(12)70235-1。Epub 2012年10月5日。 柳叶刀神经病学。2012 PMID:23041236 没有可用的摘要。
  • 危险因素与脑血管疾病。
    Anderson JT,Robertson NP。 Anderson JT等人。 神经学杂志。2013年2月;260(2):692-4. doi:10.1007/s00415-013-6835-0。 神经学杂志。2013 PMID:23355176 没有可用的摘要。

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引用人

工具书类

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