摘要
我们评估了几种（13）C代谢通量分析（MFA）方法，发现同位素非稳态MFA在培养的P493-6 B细胞中实现了最大通量分辨率，这些细胞已被设计用于提供Myc癌蛋白的可调表达。在致癌（高）和内源性（低）Myc表达水平下获得的代谢通量图的比较表明，异位Myc表达导致了网络范围的重编程。高Myc细胞比低Myc细胞更依赖线粒体氧化代谢，全球范围内上调了其相对于葡萄糖的氨基酸消耗。与葡萄糖摄取和乳酸排泄的适度增加相比，TCA循环和角代谢线粒体途径在High Myc细胞中的通量增加了2-4倍。由于我们的MFA方法完全依赖于蛋白质结合氨基酸和RNA结合核糖的同位素测量，因此它很容易适用于更复杂的肿瘤模型，这些模型不适合直接提取和对游离细胞内代谢物进行同位素分析。
版权所有©2012 Elsevier Inc.保留所有权利。
PubMed免责声明
类似文章
-
c-Myc激活多个代谢网络，生成细胞周期进入的底物。
Morrish F、Isern N、Sadilek M、Jeffrey M、Hockenbey DM。
Morrish F等人。
致癌物。2009年7月9日；28(27):2485-91. doi:10.1038/onc.2009.112。Epub 2009年5月18日。
致癌物。2009
PMID：19448666
免费PMC文章。
-
同位素非平稳13C代谢通量分析。
Jazmin LJ，Young法学博士。
Jazmin LJ等人。
方法分子生物学。2013;985:367-90. doi:10.1007/978-1-62703-299-5_18。
方法分子生物学。2013
PMID：23417813
-
OpenMebius：基于同位素非平稳13C的代谢通量分析的开源软件。
Kajihata S、Furusawa C、Matsuda F、Shimizu H。
Kajihata S等人。
生物识别研究国际2014；2014:627014. doi:10.1155/2014/627014。Epub 2014年6月11日。
生物识别研究国际2014。
PMID：25006579
免费PMC文章。
-
同位素非平稳代谢通量分析（INST-MFA）：将理论付诸实践。
Cheah YE，Young JD。
Cheah YE等人。
Curr Opin生物技术。2018年12月；54:80-87. doi:10.1016/j.copbio.2018.02.013。Epub 2018年3月6日。
Curr Opin生物技术。2018
PMID：29522915
审查。
-
MYC与肿瘤代谢：鸡和蛋。
Dejure FR、Eilers M。
Dejure FR等人。
EMBO J.2017年12月1日；36(23):3409-3420. doi:10.15252/embj.201796438。Epub 2017年11月10日。
EMBO J.2017年。
PMID：29127156
免费PMC文章。
审查。
引用人
-
癌症研究中空间解析代谢的挑战。
Lane AN，Higashi RM，Fan TW公司。
Lane AN等人。
代谢物。2024年7月11日；14(7):383. doi:10.3390/metabo14070383。
代谢物。2024
PMID：39057706
免费PMC文章。
审查。
-
MYC干扰癌症中的转录和代谢昼夜节律振荡，并促进生物合成增强。
Cazarin J、DeRollo RE、Shahidan SNABA、Burchett JB、Mwangi D、Krishnaiah S、Hsieh AL、Walton ZE、Brooks R、Mello SS、Weljie AM、Dang CV、Altman BJ。
Cazarin J等人。
公共科学图书馆-遗传学。2023年8月28日；19（8）：e1010904。doi:10.1371/journal.pgen.1010904。eCollection 2023年8月。
公共科学图书馆-遗传学。2023
PMID：37639465
免费PMC文章。
-
生物钟在癌症中的作用：机制和临床意义。
刘浩，刘毅，海瑞，廖伟，罗X。
刘华等。
基因疾病。2022年5月28日；10(4):1279-1290. doi:10.1016/j.gendis.2022.05.014。eCollection 2023年7月。
基因疾病。2022
PMID：37397565
免费PMC文章。
审查。
-
MYC干扰癌症中的转录和代谢昼夜节律振荡，并促进生物合成增强。
Cazarin J、DeRollo RE、Ahmad Shahidan SNAB、Burchett JB、Mwangi D、Krishnaiah S、Hsieh AL、Walton ZE、Brooks R、Mello SS、Weljie AM、Dang CV、Altman BJ。
Cazarin J等人。
bioRxiv[预印本]。2023年8月8日8:2023.01.03.522637。doi:10.1101/2023.01.03.522637。
生物Rxiv。2023
PMID：36711638
免费PMC文章。
已更新。
预打印。
-
共表达MYC和XBP1s的中国仓鼠卵巢细胞工程增加了细胞增殖和重组EPO的产生。
Latorre Y、Torres M、Vergara M、Berrios J、Sampayo MM、Gödecke N、Wirth D、Hauser H、Dickson AJ、Altamirano C。
Latorre Y等人。
科学报告2023年1月27日；13(1):1482. doi:10.1038/s41598-023-28622-z。
科学报告2023。
PMID：36707606
免费PMC文章。
工具书类
-
- Ahn WS，Antoniewicz MR.使用同位素示踪剂和质谱法对CHO细胞在生长期和非生长期的代谢通量进行分析。Metab Eng.2011；13:598–609.-公共医学
-
- Antoniewicz MR、Kelleher JK、Stephanopulos G.通过稳定同位素测量估算的代谢通量置信区间的测定。Metab Eng.2006；8:324–37.-公共医学
-
- Antoniewicz MR、Kelleher JK、Stephanopulos G.代谢通量分析中氨基酸质量同位素分布的准确评估。分析化学。2007年a；79:7554–7559.-公共医学
-
- Antoniewicz MR、Kelleher JK、Stephanopulos G.基本代谢物单位（EMU）：同位素分布建模的新框架。Metab Eng.2007b；9:68–86.-项目管理咨询公司-公共医学
-
- Antoniewicz MR，Kelleher JK，Stephanopulos G.采用气相色谱/质谱法测量葡萄糖氢原子的氘富集度。分析化学。2011;83:3211–6.-项目管理咨询公司-公共医学
引用
