The crystal structure of human Argonaute2

doi:10.1126/science.1221551

.2012年5月25日；336(6084):1037-40.

doi:10.1126/science.1221551。 Epub 2012年4月26日。

人类Argonaute2的晶体结构

妮可·T·席尔¹, 伊恩·麦克雷

附属公司

PMID： 22539551
预防性维修识别码： PMC3521581型
内政部： 10.1126/科学.1221551

人类Argonaute2的晶体结构

妮可·T·席尔等。科学类. 2012.

.2012年5月25日；336(6084):1037-40.

doi:10.1126/science.1221551。 Epub 2012年4月26日。

作者

妮可·T·席尔¹, 伊恩·麦克雷

附属

¹美国加利福尼亚州拉霍拉斯克里普斯研究所分子生物学系，邮编92037。

PMID： 22539551
预防性维修识别码： PMC3521581型
内政部： 10.1126/科学1221551

摘要

精氨酸蛋白构成RNA诱导沉默复合物的功能核心，该复合物在真核生物中介导RNA沉默。人类Argonaute2（Ago2）的2.3埃分辨率晶体结构揭示了一个双叶分子，其中央有一个缝隙，用于结合导向RNA和靶RNA。指导RNA异质混合物的核苷酸2至6以a型构象定位，用于与目标信使RNA的碱基配对。在核苷酸6和7之间，有一个纽结可能在微RNA靶点识别或切片RNA产物的释放中起作用。PIWI结构域中的串联色氨酸结合囊为甘氨酸-色氨酸182（GW182）或其他富含色氨酸的辅因子的募集定义了一个可能的相互作用表面。这些结果将使基于结构的方法能够利用人类未开发的RNA沉默治疗潜力。

PubMed免责声明

数字

**图1。人类Ago2的结构**
A类。Ago2一级序列示意图。B类具有N（紫色）、PAZ（海军蓝）、MID（绿色）、PIWI（灰色）结构域和连接体L1（青色）和L2（蓝色）的Ago2的前视图和顶视图。可追踪核苷酸1-8和21的通用指导RNA（红色）。色氨酸分子（橙色）与PIWI结构域中的串联疏水囊结合。

**图2。细菌和人类精氨酸结构的比较**
**答：。**Ago2的N-PAZ和MID-PIWI叶（如图1所示着色）叠加到*嗜热杆菌*（黄色）。B。Ago2的单个结构域叠加在来自*嗜热杆菌*表示等效字母的平方根偏差（rmsd）值。标记了Ago2的功能点。

**图3。结合导向RNA的构象**
A类导向RNA的5′核苷酸通过与MID和PIWI结构域的广泛相互作用而被识别。有序的水分子显示为粉红色的球体。氢键显示为橙色虚线**B、 C类**Ago2通过与磷酸盐骨架的广泛相互作用将种子区组织成A型螺旋。D类螺旋-7（α7）在碱基6和7之间的引导RNA中引入了一个扭结，从而破坏螺旋堆积。

**图4。PIWI结构域中的串联色氨酸结合囊**
**A、 B。**显示了形成色氨酸1和2结合囊的残留物，并显示了氢键（黄色虚线）。色氨酸分子与周围无偏倚的Fo-Fc图以两西格玛（橙色）轮廓显示。C类.显示色氨酸结合囊的表面表示。D。面板C中方框区域的近景。白点表示沿Ago2表面连接两个站点的最短直接路径。

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中的注释

生物化学。由导游带领前往RISC中心。
Kaya E、Doudna JA。 Kaya E等人。科学。2012年5月25日；336(6084):985-6. doi:10.1126/science.1223549。科学。2012 PMID：22628640 没有可用的摘要。

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