跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息，确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https：//确保您连接到官方网站，并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航

摘要

大多数急性髓细胞白血病（AML）患者在复发后死于进行性疾病，这与细胞遗传学水平的克隆进化有关。为了确定与复发相关的突变谱，我们对8例AML患者的原发肿瘤和复发基因组进行了测序，并使用深度测序验证了数百个体细胞突变；这使我们能够准确地定义复发时的克隆性和克隆进化模式。除了发现AML中新的复发突变基因（例如WAC、SMC3、DIS3、DDX41和DAXX）外，我们还发现AML复发期间的两种主要克隆进化模式：（1）原发肿瘤中的创始克隆发生突变并进化为复发克隆，或（2）创始克隆的一个子克隆在初始治疗后存活，获得更多突变并在复发时扩大。在所有情况下，化疗都未能根除创始克隆。对所有8例患者的复发特异性与原发性肿瘤突变进行比较后发现，颠换增加，可能是由于细胞毒性化疗引起的DNA损伤所致。这些数据表明，AML复发与新突变和克隆进化的增加有关，这在一定程度上是由患者接受的化疗形成的，以建立和维持缓解。

PubMed免责声明

数字

图1
图1。8例急性髓细胞白血病原发肿瘤和复发对捕获验证靶点的深度测序量化体细胞突变
a） 8例患者中检测到的1-3级突变总结。所有显示的突变均通过捕获和深度测序进行验证。共享突变以灰色表示，原发肿瘤特异性突变以紫色表示，复发特异性突变则以红色表示。浅灰色矩形上方显示了每个病例的1-3级突变总数。b） 原发肿瘤和UPN 933124复发病例中1-3级经验证突变的突变等位基因频率分布（左）。通过454次深度重新计数实验获得了5种原发性肿瘤特异性突变的突变等位基因频率。在原发肿瘤中发现了四个突变簇，在复发时发现了一个突变簇。聚类分析排除了已知拷贝数可变区的五个低水平突变。AML反复突变基因的非同义突变如图所示。5簇突变的突变等位基因频率在原发肿瘤和复发之间的变化如图（右）所示。c） 在另外7名AML患者的原发肿瘤和复发样本中检测到突变簇。原发肿瘤和复发样本中的簇之间的关系由连接它们的线表示。簇：一组具有相似等位基因频率的突变，可能来自同一克隆。克隆：一组突变内容相同的细胞。
图2
图2。UPN 933124中从原发肿瘤到复发的克隆进化的图形表示，以及在8个原发肿瘤和复发对中观察到的肿瘤进化模式
a） UPN 933124原发肿瘤中的创始克隆包含DNMT3A型,净现值1,PTPRT公司,SMC3、，和飞行T3这些都是AML的复发性疾病，可能与发病机制有关；创始克隆中的一个子克隆通过获得额外的突变（包括复发突变）进化为复发时的优势克隆ETV6和MYO18B，和aWNK1-WAC系列融合基因。HSC：造血干细胞。b） AML肿瘤演化的两种主要模式的例子：模型1显示原发肿瘤中的优势克隆通过获得复发特异性突变进化为复发克隆；在3对原发性肿瘤和复发配对（UPN 804168、573988和400220）中发现了这种模式。模型2显示，携带绝大多数原发肿瘤突变的小克隆存活并在复发时扩大。在5个原发肿瘤和复发对中观察到这种模式（UPNs 933124、452198、758168、426980和869586）。
图3
图3。原发肿瘤和复发样本突变类型的比较
a） 每种转移和颠倒类型中原发肿瘤和复发特异性突变的比例。b） 8例AML肿瘤和复发对的原发肿瘤和复发特异性突变的转化频率。采用比例检验对8例患者的456个复发特异性突变和3590个原发性肿瘤突变进行统计学意义评估。
请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

查看所有类似文章

引用人

查看所有“被引用”文章

工具书类

    1. Testa JR、Mintz U、Rowley JD、Vardiman JW、Golomb HM。急性非淋巴细胞白血病核型的演变。1979年癌症研究；39:3619–3627.-公共医学
    1. Garson OM等。103例复发急性髓细胞白血病患者的细胞遗传学研究。癌症基因细胞基因。1989;40:187–202。-公共医学
    1. Ley TJ等。细胞遗传学正常的急性髓细胞白血病基因组的DNA测序。自然。2008;456:66–72.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Li H等。序列比对/映射（SAM）格式和SAMtools。生物信息学（英国牛津）2009-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Chen K等。BreakDancer：基因组结构变异的高分辨率绘图算法。自然方法。2009;6:677–681.-项目管理咨询公司-公共医学

出版物类型

MeSH术语