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.2012年6月;55(6):1799-808.
doi:10.1002/hep.25569。 Epub 2012年4月24日。

肝细胞癌基因组DNA甲基化谱

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肝细胞癌基因组DNA甲基化谱

景深等。 肝病学. 2012年6月.

摘要

肝细胞癌(HCC)中经常发生DNA甲基化的改变。我们之前已经证明,在HCC诊断之前,可以在血浆DNA中检测到候选基因的高甲基化。为了通过全基因组方法识别HCC中额外的高甲基化基因,这些基因可用于更准确地分析血浆DNA以进行早期诊断,我们使用Illumina甲基化阵列(Illumina,Inc.,San Diego,CA)分析了62例台湾HCC病例的肿瘤和邻近非肿瘤组织,该阵列筛选了26486个常染色体CpG位点。在Bonferroni校正后,与非肿瘤组织相比,共有2324个CpG位点在甲基化水平上存在显著差异,其中684个Cp G位点在肿瘤中显著地高甲基化,1640个在肿瘤中低甲基化。阵列数据通过对其中五个基因的子集进行焦磷酸测序进行验证;相关系数为0.92~0.97。对38例患者血浆DNA的分析表明,37%-63%的患者分别检测到这五个基因的高甲基化DNA(≥5%甲基化)。这些基因中至少有一个在87%的病例中被甲基化,这表明在血浆样本中测量DNA甲基化是可行的。

结论:本研究中确定的甲基化基因组将在一大组前瞻性收集的样本中进行进一步测试,以确定其作为肝癌早期生物标记物的效用。

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数字

图1
图1
62对HCC肿瘤和邻近非肿瘤组织DNA甲基化差异分析的火山图。x轴显示平均DNA甲基化差异,而y轴显示调整后的–log10第页每个CpG位点的值,表示关联强度。虚线上方表示具有统计显著性(第页≤0.05)。蓝色代表邻近的非肿瘤组织,红色代表肿瘤组织。
图2
图2
62个肿瘤和邻近组织之间前1000个显著差异甲基化CpG位点的层次聚类分析
图3
图3
通过1000个三重交叉验证选择的24个超甲基化CpG位点进行层次聚类分析。蓝色代表相邻的非肿瘤组织,行代表肿瘤组织。

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工具书类

    1. Imbeaud S,Ladeiro Y,Zucman-Rossi J.肝癌中新癌基因和抑癌基因的鉴定。塞米恩肝病。2010;30:75–86.-公共医学
    1. Woo HG、Park ES、Thorgeirsson SS、Kim YJ。探索肝细胞癌的基因组图谱。霉菌致癌。2011;50:235–43.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Tischoff I,Tannapfe A.肝细胞癌中的DNA甲基化。世界胃肠病杂志。2008;14:1741–8.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Nomoto S、Kinoshita T、Kato K、Otani S、Kasuya H、Takeda S等。作为多中心肝癌克隆标记物的多基因超甲基化。英国癌症杂志。2007;97:1260–5.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Kondo Y、Shen L、Suzuki S、Kurokawa T、Masuko K、Tanaka Y等。DNA甲基化和组蛋白修饰的改变有助于肝细胞癌中的基因沉默。2007年《肝病研究》;37:974–83.-公共医学

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