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.2012年2月15日;28(4):593-4.
doi:10.1093/bioinformatics/btr708。 Epub 2011年12月23日。

ART:下一代序列读取模拟器

附属公司

ART:下一代序列读取模拟器

黄伟春等。 生物信息学. .

摘要

ART是一组生成合成下一代测序读取的模拟工具。此功能对于测试和基准测试工具对于下一代测序数据分析至关重要,包括读取比对、从头组装和基因变异发现。ART通过使用内置的、特定于技术的读取错误模型和在大型测序数据集中根据经验参数化的基本质量值剖面来模拟测序过程,从而生成模拟测序读取。我们目前支持所有三个主要的商业下一代测序平台:罗氏公司的454、Illumina公司的Solexa和应用生物系统公司的SOLiD。ART还允许灵活使用定制的读取错误模型参数和质量配置文件。

可利用性:源软件包和二进制软件包都可以在http://www.niehs.nih.gov/research/resources/software/art。

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引用人

参考文献

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