摘要
为了实现全基因组关联研究(GWAS)和转化医学的潜在力量,生物医学研究界必须采取标准措施、词汇和系统来建立可扩展的生物医学网络基础设施。纳入标准测量将极大地促进通过荟萃分析合并和比较研究。将基于共识的成熟测量方法纳入各种研究应减少因测量属性而导致的研究间差异,使研究间的结果更具可比性。本文描述了两种公认的基于共识的方法来识别标准度量和系统:PhenX(表型和eXposure的共识度量)和开放地理空间联盟(OGC)。NIH对这些工作的支持产生了PhenX Toolkit,一个用于GWAS和其他大规模基因组研究工作的标准措施汇编目录,以及RTI空间影响因素数据库(SIFD),一个符合OGC标准的地理参考变量和广泛元数据的综合库。显然需要协调发展网络基础设施,以支持加强协作和数据互操作性的措施和系统;本文讨论了确保数据兼容性和互操作性的标准协议。采用包括标准度量和词汇表的网络基础设施,以及开源系统架构,例如这里讨论的两个成熟的系统,将增强未来生物医学和转化研究的潜力。建立和维护网络基础设施需要从根本上改变研究人员对研究设计、协作、数据存储和分析的思考方式。
版权所有©2011美国预防医学杂志。爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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利益冲突声明
利益冲突声明:Schad博士得到了RTI国际研究计算部的支持,除RTI外,没有其他公司或机构附属机构。
莫布里博士在RTI国际担任高级研究员,从事这项工作,除RTI外,没有其他公司或机构附属机构。
汉密尔顿博士得到了RTI国际研究计算部和国家人类基因组研究所颁发的U01 HG004597-01奖项的支持,除RTI外,他没有其他公司或机构的附属机构。
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