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.2010年12月;84(24):12982-94。
doi:10.1128/JVI.01224-10。 Epub 2010年10月13日。

越南儿童和年轻成人登革热病毒早期全血转录特征及与登革热休克综合征进展相关的特征

附属公司

越南儿童和年轻成人登革热病毒早期全血转录特征及与登革热休克综合征进展相关的特征

Long Truong Hoang公司等。 J维罗尔. 2010年12月.

摘要

登革热是一个普遍的公共卫生问题。在儿童中,登革热休克综合征(DSS)是最常见的危及生命的并发症。预测哪些患者可能发展DSS的能力可能会改进分诊和治疗。为此,我们对24名DSS患者和56名性别、年龄和病毒血清型匹配的无并发症(UC)登革热患者的早期宿主转录特征进行了巢式病例对照比较。首先,我们定义了“早期登革热”概况。急性而非恢复期样本(发病后≤72小时)的转录特征由过多的干扰素诱导转录物(551个过多转录物中的31%)和典型的基因本体术语定义,这些术语包括:对病毒的反应、免疫反应、先天免疫反应、,和炎症反应。通路和网络分析确定STAT1、STAT2、STAT3、IRF7、IRF9、IRF1、CEBPB和SP1是介导早期反应的关键转录因子。令人惊讶的是,早期DSS和UC登革热病例的转录特征的唯一差异是进展为DSS的患者中多个中性粒细胞相关转录物的丰度更高,这一发现得到了与中性粒细胞脱颗粒相关的几种典型蛋白质(杀菌/渗透性增加蛋白[BPI]、弹性蛋白酶2[ELA2]和防御素1α[DEF1A])的较高血浆浓度的支持。中性粒细胞相关转录物水平的升高与中性粒细胞计数无关,也与感染病毒的基因型无关,如登革热病毒血清型1(DENV-1)(n=15)和登革病毒2(n=3)的基因组长度序列从DSS患者中采集的样本与从简单登革热患者中采集到的样本(32个DENV-1和9个DENV-2序列)在系统发育上没有区别。总的来说,这些数据表明中性粒细胞活化、发病机制和DSS的发展之间存在迄今尚未被认识的联系,并指出了指导预后的未来策略。

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数字

图1。
图1。
本研究中患者DENV-1共有基因组序列的系统发生树。该树(邻接法)包含从32名未合并登革热的DENV-1感染患者的血浆样本(灰色高亮尖端标签)和15名DSS感染患者的基因组样本(黑色高亮末端标签)中推导出的共识基因组序列。该树以中点为根,包含来自其他DENV-1病毒的序列,仅供参考(黑色高亮提示标签)。引导值显示在主要分支上。
图2。
图2。
本研究中患者DENV-2共有基因组序列的系统发生树。该树(邻接法)包含从9名未合并登革热的DENV-2感染患者血浆样本(灰色高亮尖端标签)和3名DSS感染患者的基因组样本(黑色高亮末端标签)中推导出的基因组序列。该树以中点为根,包含来自其他DENV-2病毒的序列,仅供参考(黑色高亮提示标签)。引导值显示在主要分支上。
图3。
图3。
AcuteDengue_DE网络。80例急性登革热患者与34例恢复期样本中差异表达基因编码的已知蛋白-蛋白质和蛋白-DNA相互作用网络。上调基因编码的节点显示为红色,下调基因编码的节显示为绿色。此网络是使用InnateDB生成的(网址:www.innateDB.com)并使用Cytoscape 2.6.2的Cerebral 2.0插件进行可视化,该插件是作为InnateDB项目的一部分开发的。该网络有289个节点和429条边。该网络中的前5个枢纽(即与其他DE基因高度连接的基因/蛋白质)被鉴定为转录因子STAT1和STAT2(2×上调)、酪氨酸激酶SRC(2×上调)、PTPN6(SHP1)(2.5×下调)和C1orf103(2×上调)。
图4。
图4。
24名DSS和56名简单登革热患者差异表达基因的灵巧途径分析(IPA)。使用IPA分析了21个差异表达转录物。确定了以下两个重要网络:癌症、细胞周期和细胞介导的免疫反应(网络1,分数为31)(A)和抗原呈递、细胞介导免疫反应和体液免疫反应(网2,分数为21)(B)。基因之间的线表示已知的交互作用,实线表示直接交互作用,虚线表示间接交互作用。不同表达的基因以红色突出显示,通过IPA识别的基因不突出显示。与这些网络相关的高分表明,它们极不可能是偶然形成的。
图5:。
图5:。
血浆样本中分泌的中性粒细胞相关蛋白的浓度。急性和恢复期登革热病例中的BPI(A)、DEF1A(B)、ELA2(C)、MPO(D)和白蛋白(E)浓度,以及其他发热性疾病患者和健康献血者血浆样本中的浓度,以供参考。盒须图表示中位数和四分位数范围。OFI,其他发热疾病。

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引用人

工具书类

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