跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息，确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https（https）：//确保您连接到官方网站，并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
。2010;12（5）：R68。
doi:10.1186/bcr2635。 Epub 2010年9月2日。

乳腺癌claudin-low固有亚型的表型和分子特征

阿莱克斯·普拉特 1, 乔尔·帕克, 奥尔加·卡吉诺娃, 程帆, 查德·利瓦西, 杰森·赫斯科维茨, 何夏平, 查尔斯·佩鲁
附属公司

乳腺癌claudin-low固有亚型的表型和分子特征

阿莱克斯·普拉特等。 乳腺癌研究。 2010。

摘要

简介：在乳腺癌中，基因表达分析确定了五种肿瘤亚型（管腔A、管腔B、HER2富集型、基底样和克劳丁-罗），每种肿瘤都具有独特的生物学和预后特征。在这里，我们全面描述了最近发现的克劳丁低肿瘤亚型。

方法：使用更新的人类肿瘤数据库和多个独立数据集，将克劳丁-罗肿瘤的临床、病理和生物学特征与其他肿瘤亚型进行比较。在一组乳腺癌细胞系和基因工程小鼠模型中，也对克劳丁低肿瘤的这些主要特征进行了评估。

结果：Claudin-low肿瘤的特征是管腔分化标记物的低表达或缺失，上皮-间充质过渡标记物的高富集，免疫反应基因和肿瘤干细胞样特征。临床上，大多数claudin低肿瘤是预后不良的雌激素受体（ER）阴性、孕激素受体（PR）阴性和表皮生长因子受体2（HER2）阴性（三阴性）浸润性导管癌，具有高频率的化生和髓质分化。他们对标准术前化疗的反应率介于基底样肿瘤和管腔肿瘤之间。有趣的是，我们发现一组高利用率的乳腺癌细胞系和一些基因工程小鼠模型表达克劳丁-罗表型。最后，我们确认在所有的乳腺癌中都存在一个与预后相关的分化层次，其中克劳丁-罗亚型与乳腺上皮干细胞最为相似。

结论：这些结果将有助于提高我们对乳腺癌生物学异质性的理解，并为进一步评估克劳丁-罗肿瘤和细胞系的独特生物学特性提供工具。

PubMed免责声明

数字

图1
图1
内在乳腺癌亚型中重要基因的平均表达和基因特征。（a）用于表征乳腺肿瘤特征的经典标记物显示了基础标记物（角蛋白5[KRT5]、14[KRT14]和17[KRT17]）、管腔标记物（角蛋白18[KRT18]和19[KRT19]）、ER（ESR1）、PR、GATA3和HER2（ERBB2）的mRNA表达水平。赖特：管腔和增殖基因特征表达的盒须图。（b）EMT标记物（波形蛋白[VIM]、蜗牛-1[SNAI1]、蜗牛-2[SNAI2]、TWIST1、TWIST 2、ZEB1、ZEB2、E-cadherin[CDH1]和克劳丁3[CLDN3]、4[CLDN4]和7[CLDN7]）。赖特：基质和免疫相关信号的表达[16,17]。（c）干细胞/TICs/上皮分化标记物（CD44、CD24、EpCAM、CD10、CD49f、CD29、MUC1、THY1和ALDH1A1）。赖特：先前发表的干细胞样特征[7]。左侧的每个彩色方块代表相对平均转录物丰度（对数2空格），最高表达为红色，平均表达为黑色，最低表达为绿色。BL，类基底；CL，SigClust定义的claudin-low[22]；富含H2、HER2；LA，管腔A；LB，管腔B；NBL，正常乳房样。P（P）显示的数值是通过比较所有亚型的基因表达平均值来计算的。
图2
图2
一组乳腺癌细胞株中克劳丁-罗亚型的鉴定人类和细胞系基因表达数据集中显示了表征每个主要人类肿瘤亚型的基因簇。在这两个数据集中，数组树都是使用Parker的内在列表通过无监督的层次聚类得到的等。[9] 如附加文件1中的图S1A和S4A所示。（a）与每种分子亚型相关的前50个上调基因，包括克劳丁低肿瘤中前50个下调基因，显示在UNC337数据库中。在每个分子亚型与其他分子亚型之间进行两级SAM（FDR=0%）后，选择了顶级基因。管腔A和B亚型合并为管腔亚型。在树中，黄色节点表示SigClust定义的克劳丁低肿瘤[22]。（b）52个Neve乳腺癌细胞系中显示了每种肿瘤分子亚型的基因簇特征等。[21]. 缺失的基因被省略了。在树中，黄色节点表示与克劳丁低亚型最相似的高度相关的细胞系。1（黄色），claudin-low基因簇的上调和下调基因；2（红色），基底样基因簇；3（粉红色），HER2富集基因簇；4（绿色），正常乳腺样基因簇；5（蓝色），管腔基因簇。
图3
图3
三个独立的乳腺癌数据集中所有固有亚型（包括克劳丁肿瘤）的临床和病理特征及预后。（a）UNC337数据集和两个公开数据集（NKI295和MDACC133）中不同临床病理特征的百分比。UNC337数据库的ER/PR/HER2评分基于临床验证方法。（b）UNC337数据库和NKI295显示了不同分子亚型的存活数据。本次分析中去除了正常的乳房样样品。UNC337数据集代表了一组按照生物标记物状态进行治疗的非均质治疗患者，而NKI295主要是一个仅进行局部治疗的队列。
图4
图4
正常乳腺组织、人乳腺肿瘤、人细胞系和小鼠乳腺肿瘤的上皮分化评分分析。（a）基于Lim的微分轴等。[24]数据。（b）哺乳动物（MMS；n个=14）来源于正常乳腺组织。黄色十字表示克劳丁低彩信(n个=6，43%）。（c）UNC337数据库中的肿瘤和正常乳腺样组。（d）乳腺癌细胞系。除了九个克劳丁低细胞系外，我们使用了Neve报告的亚型呼叫（luminal[L]和basic[B]）等。[21].（e）Herschkowitz的小鼠肿瘤等。[5].（f）从NKI113数据库获得的乳腺癌的组织学特殊类型[14]。彩色点或方框表示子类型单元格。IDC伴OGC，浸润性导管癌伴破骨巨细胞；浸润性小叶癌；BL（红色），类基底；CL（黄色），由九细胞系克劳丁-罗预测因子定义的克劳丁-洛；H2（粉红色），富含HER2；LA（深蓝色），管腔A；LB（浅蓝色），灯具B；NBL（绿色），正常胸型*P（P）< 0.0001.
图5
图5
基于分化肿瘤状态的乳腺癌患者RFS和OS。（a）UNC337和NKI295队列的Kaplan-Meier RFS和OS曲线。患者按等级排序，分为两个相等的组（低分/红色分化和高分/黑色分化）。（b）采用按队列分层的联合多变量分析，以肿瘤固有亚型、肿瘤大小、组织学分级、淋巴结状态和ER.HR、危险比为条件，检验分化状态（作为连续变量）的显著性；CI，置信区间。
图6
图6
86例乳腺肿瘤的角蛋白5/19（红色）和波形蛋白（绿色）免疫荧光（IF）染色，包括使用九细胞系克劳丁-罗预测因子鉴定的20例克劳丁-罗氏肿瘤样本。（a）在一个双阳性细胞的克劳丁低样本中，以及在无双阳性细胞腔A和正常乳腺样本中的单个和双IF染色的显微镜图片示例。（b）表中总结了阴性和阳性双重染色样品的百分比以及统计数据。
图7
图7
乳腺癌细胞系的流式细胞术及其分化状态表征。（a）EpCAM和CD49f在MCF-7（管腔）、SUM149PT（基底样）和SUM159PT（claudin低）细胞系中的表达。每个细胞系（灰色方块）中显示的门表示进一步评估的不同分类的亚群。（b）不同细胞分类亚群的分化分数。显示了每个亚群的平均值和SD。仅重要P（P）值(P（P）<0.05）。（c）SUM149PT内两个FACS分类亚群的基因表达分析。在三个独立的实验中，在两个亚群之间进行配对的两类SAM（FDR<5%）。（d）体外CD49f的分化+/EpCAM公司-/低SUM149PT电池。生长了两个SUM149PT分类的细胞亚群体外在与FACS之前相同的条件下。培养7-11天后，使用FACS重新分析两个亚群中CD49和EpCAM的表达。蓝色，MCF-7分选细胞组分；红色，SUM149PT CD49f+/高EpCAM公司+-分类亚群；橙色，SUM149PT CD49f+/EpCAM公司-/低-分类亚群；黄色，SUM159PT分类的细胞组分。在SUM149PT细胞系中添加和不添加FBS都获得了类似的结果。
请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

查看所有类似文章

引用人

查看所有“被引用”文章

工具书类

    1. Perou CM、Sorlie T、Eisen MB、van de Rijn M、Jeffrey SS、Rees CA、Pollack JR、Ross DT、Johnsen H、Akslen LA、Fluge O、Pergamenschikov A、Williams C、Zhu SX、Lonning PE、Borresen Dale A-L、Brown PO、Botstein D。人类乳腺肿瘤的分子肖像。自然。2000;406:747–752. doi:10.1038/35021093。-内政部-公共医学
    1. Sörlie T、Perou CM、Tibshirani R、Aas T、Geisler S、Johnsen H、Hastie T、Eisen MB、van de Rijn M、Jeffrey SS、Thorsen T、Quist H、Matese JC、Brown PO、Botstein D、Eystein Lónning P、Börresen-Dale AL。乳腺癌的基因表达模式区分具有临床意义的肿瘤亚类。美国国家科学院院刊，2001年；98:10869–10874. doi:10.1073/pnas.191367098。-内政部-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Carey LA、Perou CM、Livasy CA、Dressler LG、Cowan D、Conway K、Karaca G、Trotester MA、Tse CK、Edmiston S、Deming SL、Geradts J、Cheang MC、Nielsen TO、Moorman PG、Earp HS、Millikan RC。卡罗莱纳州乳腺癌研究中的种族、乳腺癌亚型和生存率。JAMA公司。2006;295:2492–2502. doi:10.1001/jama.295.21.2492。-内政部-公共医学
    1. Carey LA、Dees EC、Sawyer L、Gatti L、Moore DT、Collichio F、Ollila DW、Sartor CI、Graham ML、Perou CM。三重负悖论：乳腺癌亚型的原发性肿瘤化疗敏感性。临床癌症研究2007；13:2329–2334. doi:10.1158/1078-0432.CCR-06-1109。-内政部-公共医学
    1. Herschkowitz JI、Simin K、Weigman VJ、Mikaelian I、Usary J、Hu Z、Rasmussen KE、Jones LP、Assefnia S、Chandrasekharan S、Backlund MG、Yin Y、Khramtsov AI、Bastein R、Quackenbush J、Glazer RI、Brown PH、Green JE、Kopelovich L、Furth PA、Palazzo JP、Olopede OI、Bernard PS、Churchill GA、Van Dyke T、Perou CM。小鼠乳腺癌模型与人类乳腺肿瘤之间保守基因表达特征的鉴定。基因组生物学。2007;8:R76。doi:10.1186/gb-2007-8-5-r76。-内政部-项目管理咨询公司-公共医学

出版物类型

MeSH术语