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.2010年6月22日;107(25):11459-64.
doi:10.1073/pnas.1002443107。 Epub 2010年6月7日。

藏族高原人群低血红蛋白浓度相关EPAS1(HIF2alpha)的自然选择

附属公司

藏族高原人群低血红蛋白浓度相关EPAS1(HIF2alpha)的自然选择

辛西娅·比尔等。 美国国家科学院程序. .

摘要

通过损害功能和生存,与高海拔环境相关的氧气可用性严重降低可能成为自然选择的因素。我们使用基因组和候选基因方法来寻找这种遗传选择的证据。首先,一项全基因组等位基因分化扫描(GWADS)将青藏高原土著高原人(3200-3500米)与密切相关的低地汉族人进行了比较,结果显示位于EPAS1附近的八个SNP之间存在全基因组显著差异。该基因编码转录因子HIF2α,该转录因子刺激红细胞的生成,从而增加血液中血红蛋白的浓度。其次,在一个居住在4200米的藏族人的单独队列中,我们发现31个EPAS1 SNP处于高连锁不平衡状态,与血红蛋白浓度显著相关。与杂合子相比,主要等位基因纯合子的性别调整血红蛋白浓度平均低0.8 g/dL。这些发现在居住在4300米的第三个藏族队列中得到了复制。与血红蛋白浓度较低相关的等位基因与GWADS研究的信号相关,与汉族相比,藏族队列的频率大大提高。高血红蛋白浓度是慢性高原病的一个主要特征,为选择提供了一种可能的机制。另外,由于EPAS1的作用是多效性的,选择可能在表型的其他方面起作用。无论这些解释中的哪一种是正确的,GWADS研究中EPAS1基因座的遗传选择证据都得到了与等位基因变体相关的重复研究的支持。

PubMed免责声明

利益冲突声明

作者按字母顺序排列,并声明没有利益冲突。

数字

图1。
图1。
一项全基因组等位基因分化扫描,将中国云南省3200-3500米的藏族居民与HapMap汉族样本进行比较。八个SNP相互靠近EPAS1系统具有全基因组意义。横轴是基因组位置,颜色表示染色体。纵轴是SNP-by-SNP的负对数P(P)云南藏族与HapMap汉族比较得出的值。红线表示使用的全基因组显著性阈值(P(P)= 5 × 10−7). 使用基因组控制校正背景人群分层后显示值。
图2。
图2。
性别调整血红蛋白浓度和等位基因变异EPAS1系统中国西藏自治区马巷(4200米)藏族样本中的SNP。主要等位基因纯合子个体的平均值比杂合子个体低0.8 g/dL。(顶部)49个SNP的变异检测结果,次要等位基因频率≥5%,与性别调整血红蛋白浓度的基因型关联。(中部)每个SNP的主要等位基因纯合子和杂合子基因型之间的估计血红蛋白浓度差异(平均±95%置信区间)。实心圆圈表示检测到的SNP与血红蛋白浓度有显著关联,在整个EPAS1系统轨迹。开放钻石代表SNP,没有显著关联。(底部)成对连锁不平衡被测量为第页2SNP之间。
图3。
图3。
性别调整血红蛋白浓度和等位基因变异EPAS1系统中国西藏自治区扎西宗乡(4300米)藏族样本中的SNP。主要等位基因纯合子个体的平均值比杂合子个体低1.0 g/dL(顶部)在45个SNP中检测变异的结果,次要等位基因频率≥5%,与性别调整血红蛋白浓度的基因型关联。(中部)每个SNP的主要等位基因纯合子和杂合子基因型之间的估计血红蛋白浓度差异(平均±95%置信区间)。实心圆圈表示检测到的SNP与血红蛋白浓度有显著关联,在整个EPAS1系统轨迹。开放钻石代表SNP,没有显著关联。(底部)成对连锁不平衡被测量为第页2SNP之间。
图4。
图4。
内SNP等位基因频率的差异EPAS1系统在HapMap Han、Mag Xiang和Zhaxizong Xian队列之间。根据建筑36.1,水平轴为SNP位置。纵轴是等位基因频率,选择显示的等位基因是马向队列中最常见的一个。平方表示HapMap汉族的数据;圆圈表示马向藏人的数据;三角形表示扎西宗藏族的数据。填充符号表示在马香和扎西宗香队列中与血红蛋白有显著关联的SNP;开放符号表示没有这两种关联的SNP。

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    1. Zhao M等。线粒体基因组证据揭示了旧石器时代晚期在青藏高原的成功定居。美国国家科学院院刊2009;106:21230–21235.-项目管理咨询公司-公共医学
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