8q24 prostate, breast, and colon cancer risk loci show tissue-specific long-range interaction with MYC

doi:10.1073/pnas.0910668107

.2010年5月25日；107(21):9742-6.

doi:10.1073/pnas.0910668107。 Epub 2010年5月7日。

8q24前列腺癌、乳腺癌和结肠癌风险位点显示与MYC的组织特异性长期相互作用

纳西姆·艾哈迈迪耶¹, 马克·M·波美兰茨, 奇亚拉·格里桑齐奥, 保拉·赫尔曼, 李佳, 瓦妮莎·阿曼德罗, 侯盛汉森和, 迈尔斯·布朗, X雪莉·刘, 马特·戴维斯, 詹妮弗·卡斯韦尔, 克里斯汀·贝克维思, 亚当·希尔斯, 劳拉·麦科奈尔, 格哈德·库切, 梅雷迪斯·M·里根, 马修·弗里德曼

附属公司

PMID： 20453196
预防性维修识别码：项目经理2906844
内政部： 10.1073/第0910668107页

8q24前列腺癌、乳腺癌和结肠癌风险位点显示与MYC的组织特异性长期相互作用

纳西姆·艾哈迈迪耶等。美国国家科学院程序. 2010.

.2010年5月25日；107(21):9742-6.

doi:10.1073/pnas.0910668107。 Epub 2010年5月7日。

作者

纳西姆·艾哈迈迪耶¹, 马克·M·波美兰茨, 奇亚拉·格里桑齐奥, 保拉·赫尔曼, 李佳, 瓦妮莎·阿曼德罗, 何厚生Hansen, 迈尔斯·布朗, X雪莉·刘, 马特·戴维斯, 詹妮弗·L·卡斯维尔, 克里斯汀·贝克维思, 亚当·希尔斯, 劳拉·麦科奈尔, 格哈德·库切, 梅雷迪斯·M·里根, 马修·弗里德曼

附属

¹美国马萨诸塞州波士顿达纳-法伯癌症研究所肿瘤内科，邮编02115。

PMID： 20453196
预防性维修识别码：项目经理2906844
内政部： 10.1073/pnas.0910668107

摘要

8q24基因沙漠包含多种上皮癌的风险位点，包括结肠癌、乳腺癌和前列腺癌。最近的证据表明这些风险位点含有增强子。在这项研究中，数据显示，每个风险基因座都具有与增强子元件一致的表观遗传标记，并与位于数百千碱基端粒的MYC原癌基因形成长程染色质环，这些相互作用是组织特异性的。因此，我们建议8q24风险位点通过MYC的组织特异性增强子这一共同机制发挥作用。

PubMed免责声明

利益冲突声明

作者声明没有利益冲突。

数字

**图1。**
染色体8q24上癌症风险位点的表观遗传注释与增强子活性一致。(顶部)8q24的800-kb区域包含前列腺癌、乳腺癌和结肠癌风险基因座以及*MYC公司*原癌基因。(中部)风险位点内约有6-kb片段，带有组蛋白乙酰化的表观遗传标记（8）。红色条代表3C分析的限制片段，用于与*MYC公司*紫色条包含使用ChIP-qPCR平铺引物询问的片段。(底部)通过ChIP-qPCR对组蛋白3赖氨酸4二甲基化（H3K4me2）和p300进行折叠富集，±1 SD。

**图2。**
危险位点8q24区和3C相互作用频率*MYC公司*:x个轴：基因组位置（未按比例绘制）；年轴：恒定碎片与每个目标碎片的3C相互作用频率±1 SEM，包括*MYC公司*归一化为管家基因内的3C相互作用，*家庭32a*. (A类)描绘与最近基因相关的8q24风险位点的示意图，以及被询问的恒定片段（红色勾选）和目标片段（黑色勾选）的位置；(B)结肠癌细胞系LS174T中结肠癌危险位点（红线图）和前列腺癌区域2（蓝线图）3C相互作用频率的标准化；(C)乳腺癌细胞系MCF-7中乳腺癌危险位点（黄线图）和前列腺癌区域2（蓝线图）3C相互作用频率的标准化；(D类)前列腺癌细胞系LNCaP中前列腺癌区域2（蓝线图）和乳腺癌风险区域（黄线图）的标准化3C相互作用频率。垂直阴影线表示各自恒定片段的基因组位置（彩色编码）。

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1. Kiemeney LA等人。8q24的序列变异与膀胱癌的易感性有关。自然遗传学。2008;40:1307–1312.-项目管理咨询公司-公共医学
1. Haiman CA等。8q24内的多个区域独立影响前列腺癌风险。自然遗传学。2007;39:638–644.-项目管理咨询公司-公共医学
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[3] Ghoussaini M等人。英国前列腺癌基因研究合作者/英国泌尿外科医师协会肿瘤科。英国ProtecT研究合作者8q24基因沙漠中具有不同癌症特异性的多个基因座。2008年国家癌症研究所杂志；100:962–966.-项目管理咨询公司-公共医学

[4] Ghoussaini M等人。英国前列腺癌基因研究合作者/英国泌尿外科医师协会肿瘤科。英国ProtecT研究合作者8q24基因沙漠中具有不同癌症特异性的多个基因座。2008年国家癌症研究所杂志；100:962–966.-项目管理咨询公司-公共医学

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[6] Kiemeney LA等人。8q24的序列变异与膀胱癌的易感性有关。自然遗传学。2008;40:1307–1312.-项目管理咨询公司-公共医学

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[9] Easton DF等。搜索合作者。kConFab公司。AOCS管理小组全基因组关联研究确定了新的乳腺癌易感性位点。自然。2007;447:1087–1093.-项目管理咨询公司-公共医学

[10] Easton DF等。搜索合作者。kConFab公司。AOCS管理小组全基因组关联研究确定了新的乳腺癌易感性位点。自然。2007;447:1087–1093.-项目管理咨询公司-公共医学

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