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.2010年2月3日8:12。
doi:10.1186/1741-7015-8-12。

DNA甲基转移酶-3A启动子的功能多态性改变胃癌的易感性,但不改变食管癌的易感性

附属公司

DNA甲基转移酶-3A启动子的功能多态性改变胃癌的易感性,但不改变食管癌的易感性

洪帆等。 BMC医学. .

摘要

背景:DNA-甲基转移酶(DNMT)-3A在胚胎发育和癌变过程中异常甲基化的产生中起着重要作用。本研究的目的是研究DNMT3A启动子遗传变异对其转录活性的作用,并评估DNMT3A基因多态性与中国人群胃癌(GC)和食管癌(EC)易感性之间的关系。

方法:我们在DNMT3A启动子区选择了一个单核苷酸多态性(SNPs)-448A>G,并使用荧光素酶分析评估其对活性的影响-通过聚合酶链反应/限制性片段长度多态性测定DNMT3A的448A>G多态性,并通过测序确认。在208名GC患者和346名年龄和性别匹配的健康对照中检测到-448A>G多态性的分布。在96名EC患者和241名健康对照组中也检测到-448A>G多态性的分布。根据患者的年龄和性别,通过分层分析评估DNMT3A的-448A>G多态性与GC和EC风险的相关性。

结果:在启动子分析中,与-448G等位基因相比,携带-448A等位基因的启动子活性显著提高(>2倍)(P<0.001)。GC患者和对照组中-448A的等位基因频率分别为32.9%和19.9%。总的来说,我们发现,与GG携带者相比,DNMT3A-448AA纯合子患GC的风险增加了六倍以上。分层分析表明,AA纯合子在GC年龄≥60岁的个体亚群中具有更大的风险。然而,与携带448GG基因型的个体相比,携带448AG和448AA的个体与EC风险增加没有统计学上的显著相关性。

结论:DNMT3A-448A>G多态性是一种新的功能性单核苷酸多态性,与GC的遗传易感性有关-448A>G可以作为一个分层标记物来预测个体对GC的易感性,特别是在年龄≥60岁的个体亚组中。然而,在EC中-448A>G的相对分布不能用作评估个体对EC易感性的预测标志。

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数字

图1
图1
DNMT3A启动子-448G>A多态性的转录活性分析用荧光素酶报告体瞬时转染中国仓鼠卵巢细胞。缺失启动子序列的pGL3-碱性质粒用作阴性对照。数据表示从四个独立实验中计算出的三倍平均标准偏差,并以-448A等位基因活性的百分比表示。-448G和-448A结构之间的差异在P(P)< 0.001 (t吨-测试;n个= 6).
图2
图2
不同-448G>A基因型聚合酶链反应(PCR)产物的测序结果强调了单核苷酸多态性位点。结果与PCR-限制性片段长度多态性基因分型的相应结果完全匹配。A: AA变异体(反链),B:GG野生型(反向链)。
图3
图3
胃癌及其癌旁组织中DNMT3A的表达DNMT3A呈棕色,在细胞质中分布良好。(A,B)胃癌旁组织(A,×100和B,×400)中DNMT3A的免疫组织化学染色。(C,D)胃癌组织中DNMT3A的免疫组化染色(C,×100;D×400)。

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引用人

工具书类

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