PrimerBank: a resource of human and mouse PCR primer pairs for gene expression detection and quantification

doi:10.1093/nar/gkp1005

.2010年1月；38（数据库问题）：D792-9。

doi:10.1093/nar/gkp1005。 Epub 2009年11月11日。

PrimerBank：用于基因表达检测和量化的人和鼠PCR引物对资源

阿萨纳西亚·斯潘迪多斯¹, 王晓伟, 王华军, 布莱恩·赛德

附属公司

PMID： 19906719
预防性维修识别码： PMC2808898型
内政部： 10.1093/nar/gkp1005

PrimerBank：用于基因表达检测和量化的人和鼠PCR引物对资源

阿萨纳西亚·斯潘迪多斯等。核酸研究. 2010年1月.

.2010年1月；38（数据库问题）：D792-9。

doi:10.1093/nar/gkp1005。 Epub 2009年11月11日。

作者

阿萨纳西亚·斯潘迪多斯¹, 王晓伟, 王华军, 布莱恩·赛德

附属

¹美国马萨诸塞州总医院计算与综合生物学中心哈佛医学院遗传学系，马萨诸塞州立大学波士顿02114-2790。

PMID： 19906719
预防性维修识别码： PMC2808898型
内政部： 10.1093/nar/gkp1005

摘要

PrimerBank银行(http://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/)是检索人类和小鼠引物对的公共资源，用于通过PCR和定量PCR（QPCR）进行基因表达分析。从PrimerBank数据库中可以访问涵盖大多数已知人类和小鼠基因的306800个引物，以及这些引物的信息，如T（m）、转录本上的位置和扩增子大小。对于每个基因，至少设计了一对引物，在许多情况下，存在替代引物对。引物设计为在相同PCR条件下工作，从而促进高通量QPCR。有几种方法可以搜索感兴趣基因的引物，例如：GenBank登录号、NCBI蛋白登录号、NSBI基因ID、PrimerBank ID、NCBI-基因符号或基因描述（关键字）。总之，涵盖大多数已知小鼠基因的26855对引物已通过QPCR、琼脂糖凝胶分析、测序和BLAST进行了实验验证，所有验证数据均可从PrimerBank网站免费获取。

PubMed免责声明

数字

**图1。**
PrimerBank对β-actin引物的搜索结果。引物搜索功能可以在PrimerBank主页上找到。通过PrimerBank ID（6671509a1）在数据库中搜索小鼠β-actin引物对，获得的搜索结果如下所示。引物序列、长度、，T型_米s、可以看到引物在扩增子上的位置和预期的扩增子大小。

**图2。**
β-肌动蛋白引物的cDNA和扩增子序列。完整的cDNA和扩增子序列以及扩增子上突出显示的引物位置见此处，点击引物信息网页上的cDNA和扩增子序列链接可以从PrimerBank中查看（见图1）。

**图3。**
β-肌动蛋白引物的实验验证数据。所有实验验证数据都显示在这里，可以通过点击引物信息网页（见图1）和cDNA和扩增子序列网页（见图2）上的验证结果链接从PrimerBank查看。可以看到QPCR扩增图、解离曲线和琼脂糖凝胶数据，然后是获得的序列，用户可以滚动浏览。测序结果下方可以看到获得的BLAST结果摘要。BLAST结果下方有一个BLAST工具，可用于直接BLAST根据NCBI数据库获得的序列。此外，还可以看到一个反馈表，用户可以在其中使用引物提供有关其实验数据的信息。

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