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.2009年12月1日；25(23):3181-2.
doi:10.1093/bioinformatics/btp554。 Epub 2009年9月22日。

MOODS：快速搜索DNA序列中的位置权重矩阵匹配

赫宁 1, 佩特里·马丁马基, 辛齐娅·皮兹, 帕西·拉斯塔斯, 埃斯科·乌科宁
附属公司

MOODS：快速搜索DNA序列中的位置权重矩阵匹配

赫宁等。 生物信息学. .

摘要

MOODS（MOtif Occurrence Detection Suite）是一个软件包，用于根据DNA序列匹配位置权重矩阵。MOODS实现了最先进的在线匹配算法，与简单的强制搜索相比，扫描速度要快得多。MOODS是用C++编写的，带有流行的BioPerl和Biopython工具包的绑定。它可以很容易地适应不同的目的，并集成到现有的工作流中。它也可以用作C++库。

可利用性：包含文档和使用示例的软件包位于http://www.cs.helsinki.fi/group/pssmfind。源代码也可以根据GNU通用公共许可证（GPL）的条款获得。

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