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.2010年1月;18(1):125-9.
doi:10.1038/ejhg.2009.121。

DFNB79:染色体9q34.3上一个非综合征性耳聋基因座的转世

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DFNB79:染色体9q34.3上一个非综合征性耳聋基因座的转世

沙希德·亚尔·汗等。 欧洲人类遗传学杂志. 2010年1月.

摘要

一个近交巴基斯坦家族PKDF280的遗传分析,分离出语前严重到重度感音神经性聋,为人类染色体9q34.3上的DFNB基因座提供了证据。通过两点连锁分析(θ=0时LOD得分为9.43)确定耳聋特征与标记D9SH159的共进化。另外两个大家族,PKDF517和PKDF741,通过与同一区间相关的标记物共同分离隐性耳聋。这三个家族的单倍型分析将D9S1818(着丝粒)和D9SH6(端粒)定义的间隔细化为3.84 Mb。该区间与先前报道的DFNB33基因座重叠,该基因座的染色体图谱位置最近被修改并分配到染色体10p111.23-q21.1上的一个新位置。PKDF280家族9q染色体上分离的非综合征性耳聋基因座命名为DFNB79。我们目前正在筛选113个候选DFNB79基因的突变,并排除了CACNA1B、EDF1、PTGDS、EHMT1、QSOX2、NOTCH1、MIR126和MIR602。

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数字

图1
图1
PKDF280家族系谱。填充符号代表听力受损的人。连接的单倍型被装箱。根据UCSC基因组生物信息学构建36.1,STR标记及其相对地图位置(Mb)(http://genome.ucsc.edu/)与血统一起显示。PKDF280的单倍型定义了~3.84 Mb的连锁区域。受影响个体VI:2在标记处提供了近端重组断点D9S1818型(136.27兆字节)。
图2
图2
PKDF517和PKDF741家族的系谱。连接的单倍型被装箱。PKDF517家族的单倍型分析确定了3.84Mb的连锁区间,该连锁区间由标记限定1818年9月(136.27 Mb)和D9SH6型(140.11兆字节)。在PKDF741家族中,两个受影响个体(IV:4和IV:5)的减数分裂重组在D9S1818型(136.27兆字节)。这个DFNB79型PKDF741家族的连锁区间延伸到端粒。
图3
图3
DFNB79型染色体定位在9q34.3。物理地图距离来自UCSC基因组生物信息构建36.1。STR标记由实心圆圈表示。显示了该区间内的所有已知基因和预测转录单位。候选基因从近端基因排序(RXRA公司)第1列中的远端基因(CR616254号)在第4列的底部。标记D9S1818型(136.27 Mb)和D9SH6型(140.11 Mb)定义了DFNB79型关键联动间隔。
图4
图4
来自三个DFNB79家族PKDF280、PKDF517和PKDF741中每一个家族的受累个体的声像图。听力检查时的年龄分别为~15岁、21岁和9岁。符号“o”和“x”表示左右耳在不同频率下的空气传导纯音阈值。

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引用人

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