跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息，确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

网站是安全的。
这个https（https）：//确保您连接到官方网站，并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2009年3月27日；323(5922):1693-7.
doi:10.1126/science.1167983。

内质网蛋白质折叠所需基因的综合表征

马丁·乔尼卡斯 1, 肖恩·柯林斯, 弗拉基米尔·丹尼克, 尤金·奥, 艾琳·M·泉, 沃尔克·施密德, 吉梅娜·韦比扎恩, 布兰奇·施瓦巴赫, 彼得·沃尔特, 乔纳森·魏斯曼, 玛娅·舒尔迪纳
附属公司

内质网蛋白质折叠所需基因的综合表征

马丁·乔尼卡斯等。 科学类. .

摘要

内质网中的蛋白质折叠是一个复杂的过程，其功能失常与疾病和衰老有关。通过使用细胞的内源性传感器（未折叠蛋白反应），我们鉴定了数百个在内质网折叠中起作用的酵母基因，并通过测量双突变体中的未折叠蛋白响应水平，系统地描述了它们的功能相关性。该策略揭示了对内质网折叠至关重要的多种保守因子，包括对后期分泌途径的密切依赖，一种以前没有特征化的六蛋白跨膜复合物，以及一种将尾锚定蛋白传递到膜插入机制的共伴侣复合物。在综合筛选中使用定量报告器，然后对遗传依赖性进行系统分析，应广泛适用于从酵母到人类的复杂细胞过程的功能解剖。

PubMed免责声明

数字

图1
图1
干扰UPR信号的基因缺失的定量筛查。（A）量化缺失菌株中UPR水平的策略。（B）GFP/RFP报告水平是DTT浓度的函数，DTT是一种导致内质网蛋白质错误折叠的还原剂。（C）按功能类别划分的UPR报告人上调点击率水平。
图2
图2
双突变体分析提供了基因之间功能依赖性的信息。（A）“双突变体”（DM）图Δhac1每个点代表一个基因。X坐标表示在WT背景中为该基因删除的菌株的报告水平。Y坐标表示缺乏相同基因的双突变体中的报告水平，并为第二个基因额外删除（在本例中HAC1型)。蓝色水平线表示Δhac1单个突变体。红色圆圈表示报告诱导为HAC1类-独立，高度富集染色质结构因子。（B）（上图）N-连接聚糖合成途径的内腔步骤示意图。（底部）DM图Δdie2/alg10.（C）DM图描述了缺失突变体和ERAD底物KWS过度表达（OE）之间的遗传交互作用。
图3
图3
遗传相互作用的系统鉴定。（A）说明双突变体报告水平分布的广义DM图ΔxxxΔyfg根据单个突变体的报告水平绘制Δxxx。红色曲线追踪典型的双突变报告水平，作为单突变报告水平的函数。相互作用值（π-分数）由双突变体中预期和测量的UPR水平之间的差异决定。具有异常高荧光（蓝色圆点）、典型荧光（黑色圆点）或异常低荧光（黄色圆点）的双突变体分别表示加重、无或减轻遗传相互作用。在水平蓝线上发现完全掩蔽的相互作用(Δyfg完全遮罩Δxxx)或在蓝色对角线上(Δxxx完全遮罩Δyfg).（B）基于系统π得分分析的遗传互作图的层次聚类。在地图的右侧，标记了功能集群（表S5）。文本中提到的集群以红色突出显示；那些含有新成分的用斜体标记。
图4
图4
遗传相互作用识别未表征蛋白质的功能依赖性。（A）的DM图Δhrd3（插图）图3B的一个区域放大，显示ERAD簇的遗传相互作用。（B）ER膜复合物（EMC）的选定遗传相互作用。（C）Emc3p-FLAG及其相关蛋白免疫沉淀的SDS-PAGE分析；用质谱法测定蛋白质的特性*Por1p相互作用的特异性尚未评估。
图5
图5
约尔164C/GET4和MDY2/GET5型尾锚定蛋白插入途径中的功能。（A）描述功能依赖性的DM图MDY2/GET5型.（B）体内易位分析。Sec22p在野生型（WT）或Δmdy2/get5菌株。误差条代表+/-SEM，N=3（C）GFP-Sed5p定位缺陷Δget3，Δget4和Δmdy2/get5菌株。每个菌株至少20个具有相似平均荧光的细胞的图像被量化，以确定每个菌株的总荧光在不同强度像素上的分布。（D）ER微粒体和胞浆Get3-FLAGp免疫沉淀银染法；用质谱法测定蛋白质的特性。
请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

查看所有类似文章

引用人

  • 膜蛋白生物生成的统一模型。
    Hegde RS、Keenan RJ。 Hegde RS等人。 自然结构分子生物学。2024年5月29日。doi:10.1038/s41594-024-01296-5。打印前在线。 自然结构分子生物学。2024 PMID：38811793 审查。
  • 对人类EMC及其与VDAC相互作用的结构性见解。
    李M，张C，徐Y，李S，黄C，吴杰，雷M。 李明等。 老龄化（纽约奥尔巴尼）。2024年3月15日；16(6):5501-5525. doi:10.18632/aging.205660。Epub 2024年3月15日。 老龄化（纽约奥尔巴尼）。2024 PMID：38517390 免费PMC文章。
  • G1期快速作用的脂质检查点可防止有丝分裂缺陷。
    Köberlin MS、Fan Y、Liu C、Chung M、Pinto AFM、Jackson PK、Saghatelian A、Meyer T。 Köberlin MS等人。 国家公社。2024年3月18日；15(1):2441. doi:10.1038/s41467-024-46696-9。 国家公社。2024 PMID：38499565 免费PMC文章。
  • 生理冒险白色念珠菌：法尼醇和泛醌。
    Nickerson KW、Gutzmann DJ、Boone CHT、Pathirana RU、Atkin AL。 Nickerson KW等人。 《微生物分子生物学评论》2024年3月27日；88（1）：e0008122。doi:10.1128/mmbr.0081-22。Epub 2024年3月4日。 微生物分子生物学修订版2024。 PMID：38436263 审查。
  • 工业用丝状真菌的蛋白质分泌和相关应激。
    贾达夫R、马赫RL、马赫点火器配置总成。 Jadhav R等人。 应用微生物生物技术。2024年12月；108(1):92. doi:10.1007/s00253-023-12985-4。Epub 2024年1月10日。 应用微生物生物技术。2024 PMID：38204136 免费PMC文章。 审查。
查看所有“引用者”文章

工具书类

    1. Lin JH，Walter P，Yen TS.病理学年鉴。2008;3:399.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Scheuner D，Kaufman RJ.Endocr Rev.2008年5月；29:317.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Hebert DN，Molinari M.Physiol Rev.2007年10月；87:1377.-公共医学
    1. Trombetta ES，Parodi AJ。年收入细胞开发生物。2003;19:649.-公共医学
    1. Ron D，Walter P.Nat《分子细胞生物学评论》。2007年7月；8:519.-公共医学

出版物类型