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.2009年3月;155(第3部分):733-740。
doi:10.1099/mic.0.23960-0。

短基序序列决定原核CRISPR防御系统的靶点

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短基序序列决定原核CRISPR防御系统的靶点

F J M Mojica先生等。 微生物学(阅读). 2009年3月.
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摘要

簇状规则间隔短回文重复序列(CRISPR)及其相关的CRISPR-associated sequence(CAS)蛋白构成了广泛存在于原核生物中的新型抗病毒防御系统。重复序列被间隔物隔开,其中一些与活动遗传元件中的序列同源。虽然所涉及的整个过程仍然没有特征化,但已知在噬菌体攻击期间,新的间隔物被并入宿主的CRISPR位点,从而产生对病毒的特异性抗性。此外,已经证明这种干扰是基于携带间隔物的小RNA。这些RNA将引导防御装置识别携带与间隔物匹配序列的外来分子。尽管有这一重要作用,但间隔物吸收机制尚未得到解决。第一步是检测与嗜热链球菌间隔区前体(原间隔区)相关的基序,揭示了对该物种供体序列的特异识别。在这里,我们表明,对于大多数不同的CRISPR系统来说,保护原空间相邻基序(PAM)是一个共同的主题。PAM序列取决于CRISPR-CAS变体,这意味着存在一种CRISPR类型特定(基序定向)的间隔物选择,随后确定干扰目标。PAM还可以指导重复阵列中垫片的方向。值得注意的是,基于这种极性的观察结果反对将转录物RNA分子上的间隔区前体识别为一般规则。

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