Genome-wide transcriptional profiling linked to social class in asthma

doi:10.1136/thx.2007.095091

。2009年1月；64(1):38-43.

doi:10.1136/thx.2007.095091。 Epub 2008年11月10日。

哮喘患者与社会阶层相关的基因组转录谱分析

E Chen先生¹, G E米勒, H A沃克, J M阿雷瓦洛, 宋锡悦, S W科尔

附属公司

PMID： 19001005
预防性维修识别码： PMC2717793
内政部： 10.1136/泰铢2007.095091

哮喘患者与社会阶层相关的基因组转录谱分析

E Chen先生等。胸部。 2009年1月。

。2009年1月；64(1):38-43.

doi:10.1136/thx.2007.095091。 Epub 2008年11月10日。

作者

E Chen先生¹, G E米勒, H A Walker公司, J M阿雷瓦洛, C Y Sung先生, S W科尔

附属

¹加拿大不列颠哥伦比亚大学温哥华心理学系。echn@psych.ubc.ca

PMID： 19001005
预防性维修识别码： PMC2717793
内政部： 10.1136/泰铢2007.095091

摘要

目标：低社会经济地位（SES）是与疾病发病率相关的最强大的社会因素之一，包括儿童期更严重的哮喘。然而，我们对解释这种联系的生物过程的理解是有限的。这项研究测试了社会环境是否能“深入”改变哮喘儿童的基因组活动。

设计和参与者：对来自低或高社会经济地位家庭的医生诊断为哮喘的儿童进行两组设计。

成果：哮喘儿童T淋巴细胞的基因组转录谱。

结果：与SES背景较高的哮喘儿童相比，SES背景较低的哮喘儿童显示出调节炎症过程的基因过度表达，包括那些参与趋化因子活性、应激反应和创伤反应的基因。生物信息学分析表明，环AMP反应元件结合蛋白和核因子Y活性的降低以及核因子κB转录信号的增加介导了这些效应。已知这些途径调节免疫细胞中的儿茶酚胺和炎症信号。

结论：这项研究在诊断为哮喘的儿科患者样本中提供了第一个证据，即更大的社会环境可以影响基因组水平的过程。具体而言，在哮喘儿童中，调节炎症和儿茶酚胺信号传导的基因转录控制途径因SES而异。由于这些途径是许多哮喘药物的主要靶点，这些研究结果表明，更大的社会环境可能会改变影响哮喘治疗效果的分子机制。

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数字

图1
转录因子结合基序在低社会经济地位（SES）和高社会经济地位背景的哮喘儿童中过度表达的基因启动子中表现出差异。数据表示各组启动子中反应元件的平均（SEM）流行率。活化蛋白1；CREB，环AMP反应元件结合蛋白；核因子κB；NF-Y，核因子Y。

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