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.2008年10月31日;322(5902):750-6.
doi:10.1126/science.1163045。

短重复RNA靶向小鼠X染色体的多梳蛋白

附属公司

短重复RNA靶向小鼠X染色体的多梳蛋白

赵静(音译)等人。 科学类. .

摘要

为了使性别间的X染色体剂量相等,雌性哺乳动物会使其两条X染色体中的一条失活。X染色体失活(XCI)是由Xist的表达启动的,Xist是一种17-kb的非编码RNA(ncRNA),顺式积累在X上。由于相互作用的因素尚未被分离出来,Xist诱导沉默的机制尚不清楚。我们在Xist中发现了一个1.6千碱基的ncRNA(RepA),并确定Polycomb复合体PRC2为其直接靶点。PRC2最初由RepA RNA招募到X,Ezh2作为RNA结合亚单位。反义Tsix RNA抑制这种相互作用。RepA缺失消除了X的组蛋白H3的赖氨酸27上的全长Xist诱导和三甲基化。同样,PRC2缺乏会损害Xist的上调。因此,需要RepA和PRC2来启动和传播XCI。我们得出结论,ncRNA辅因子将Polycomb复合物招募到其靶位点。

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数字

图1
图1。PRG2复合体包含Xist
A.地图西斯特。B、 指示细胞中的C,D.RIP,α,抗体。核糖核酸酶预处理对RIP信号的影响。F.通过实时PCR将R1处的链特异性RIP归一化为输入RNA。误差栏,1个标准偏差(SD)。G.通过实时PCR在R1–R5位置定量RIP。H.DNA ChIP使用指示抗体,显示为输入的一部分,并标准化为正常IgG ChIP。
图2
图2。Xist中的一个小RNA
A.地图回购协议和5′端西斯特。B、 C.链特异性实时PCR定量ES细胞(B)或MEFs(C)中R6–R9的RNA拷贝,标准化为标准曲线。D.使用RepA探针的RNA FISH。E.RepA和Tsix的北部分析(5′和3′位置)。F.3′RepA种族。G.荧光素酶报告子瞬时转染构建比较RepA(bp79-320)和Xist P1启动子,每个启动子均归一化为载体控制。P(P),学生t吨-在指示的两两比较中进行测试。H.DNA鱼类回购协议转基因雌性ES细胞。Xist P1启动子不在转基因中。箭头,转基因。Tsix公司通过pSx7检测。I.代表性克隆B5和C5+/-多西环素诱导中的定量RIP。无抗体对照未产生可检测的RNA。
图3
图3。RepA RNA直接结合PRC2体外试验。
A.一次重复一个单位。WT,野性感。哑巴,变异。AS,反义。DsI和DsII,随机Xist序列。B.EMSA使用雌性ES核提取物(NE)。竞争对手的摩尔过量为500倍。箭头,感测位移。箭头,AS shift。C.反义结合由感觉而非非特异性RNA竞争。D.EMSA超位移(*)与α-Ezh2。E.EMSA使用重组hPRC2(sub)复合物。fEzh2,果蝇Ezh2。hPRC2受反义而非随机探针结合。
图4
图4。RepA/PRC2击倒危及XCI启动
A.敲除克隆中的Xist RNA-H3K27me3免疫FISH。shRNA:RA、RepA。X1,Xist外显子1。Scr,加扰控制。B.击倒克隆中指定位置的Xist和Tsix水平。C.ImmunoFISH:Xist上调的频率(Xist+)和H3-K27me3病灶。P(P),与Xist的Scr-12控件进行成对比较+频率。D.shRNA克隆中的EB生长。Eed、Ezh2或对照敲除后的E.Xist-H3K27me3免疫FISH。F.Eed和Ezh2mRNA水平Tsix公司Δ/+ES细胞。P(P),学生t吨-测试。指示敲除后的Xist RNA的G.qRT-PCR。P(P),学生t吨-测试。H.ImmunoFISH:在指示敲除后,Xist上调和H3-K27三甲基化的频率。P(P)比较了对照组(“预期”)和Eed/Ezh2击倒组中的Xist焦点数。
图5
图5。XCI后核周隔区PRC2和Xi联合
A.免疫染色:Ezh2和Suz12集中在核仁周围(B23+)。B.Ezh2和Suz12表现出核周富集,但H3K9me3没有。C.Xist RNA-Ezh2免疫鱼类。Xa中的D.Xist DNA-Ezh2免疫FISH重量Xi(希)Δ西斯特MEF(6)。E.总结和模型。

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