The role of positive selection in determining the molecular cause of species differences in disease

doi:10.1186/1471-2148-8-273

比较研究

.2008年10月6日8:273。

doi:10.1186/1471-2148-8-273。

正选择在确定疾病物种差异的分子原因中的作用

杰西卡·瓦马蒂万¹, 萨米乌尔·哈桑, 理查德·德·埃姆斯, 希瑟·阿姆林·马德森, 迪利普·拉贾戈帕兰, 西蒙·D·托普, 当地警官库玛尔, 迈克尔·沃德, 马克·D·西蒙斯, 史蒂芬·M·福特, 菲利普·桑索, 杨紫恒, 乔安娜·D·霍尔布鲁克

附属公司

PMID： 18837980
PMCID公司： PMC2576240型
内政部： 10.1186/1471-2148-8-273

比较研究

正选择在确定疾病物种差异的分子原因中的作用

杰西卡·瓦马蒂万等。 BMC进化生物学. 2008.

.2008年10月6日8:273。

doi:10.1186/1471-2148-8-273。

作者

附属

¹1英国伦敦WC1E 6BT高尔街达尔文大厦伦敦大学学院生物系。j.vamathevan@ucl.ac.uk

PMID： 18837980
PMCID公司： PMC2576240型
内政部： 10.1186/1471-2148-8-273

摘要

背景：相关物种，如人类和黑猩猩，经常会经历同样的疾病，病理程度不同，如阿尔茨海默病，或艾滋病的不同症状。此外，由于与生活方式无关的原因，某些疾病如精神分裂症、上皮癌和自身免疫性疾病在人类中的发病率远高于其他物种。在物种进化过程中经历了正向选择的基因表明了导致物种差异的功能性适应。因此，我们研究了物种间的生物医学疾病差异是否可以归因于正选择的基因。

结果：我们确定了在人类和四种常用于模拟人类疾病的哺乳动物（小鼠、大鼠、黑猩猩和狗）的进化过程中可能经历正选择的基因。我们发现，预测在人类进化过程中受到正选择压力的基因与上皮癌、精神分裂症、自身免疫性疾病和阿尔茨海默病等疾病有关，所有这些疾病在人类及其哺乳动物亲属之间的发病率和症状都不同。与之前的研究一致，我们发现黑猩猩谱系比其他谱系具有更多的正选择基因。此外，我们发现了新的证据来支持这样一种假设，即经历了正向选择的基因往往会相互作用。这是第一个在哺乳动物基因中广泛检测到的此类证据，可能对确定导致物种差异的分子途径很重要。

结论：我们的基因数据集预测在五个物种中进行了正向选择，这是一个信息资源，可以在药物靶点验证期间选择合适的动物模型之前进行参考。我们的结论是，研究物种间功能性疾病和生物医学疾病差异的演变是深入了解其分子原因的重要途径，并可能提供一种方法来预测动物模型何时不符合人类生物学。

PubMed免责声明

数字

图1
**具有分支特异性的五种树ω比率**.中位数ω自由比率模型估计了3079个基因对人类、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗的进化速率。

图2
**PSG过度表示生物过程本体**.过度表示PSG的生物过程本体术语(第页< 0.05). 本体术语按功能蛋白PANTHER生物过程家族分类。

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