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.2008年2月29日;25(1):142-7.

牛内源性逆转录病毒beta3基因组的特征

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牛内源性逆转录病毒beta3基因组的特征

芮晓等。 分子细胞. .
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摘要

我们最近使用简并PCR和地方特异性PCR方法来鉴定牛基因组中的内源性逆转录病毒(ERV)。利用绵羊ERV分类系统,牛ERV可分为四个科。在这里,我们用BERVβ3家族的pro/pol区的部分核苷酸序列搜索了最近发布的牛基因组数据库。这使我们能够获得并分析BERVβ3的完整基因组。BERV beta3基因组长7666个核苷酸,具有典型的逆转录病毒组织,即5’-长末端重复序列(LTR)-gag-pro-pol-env-LTR-3’。推导出BERVβ基因编码507、271、879和603氨基酸的gag、pro、pol和env的开放阅读框。BERV beta3与其他β逆转录病毒的氨基酸相似性很小。系统发育分析表明,该病毒与HERV-K病毒聚集在一起。这是首次报道描述整个BERV的遗传结构和序列。

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