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比较研究
.2008年1月;4(1):e10。
doi:10.1371/journal.pgen.0040010。 Epub 2007年12月13日。

TERT通过Myc和Wnt相关发育程序的转录控制促进上皮细胞增殖

附属公司
比较研究

TERT通过Myc和Wnt相关发育程序的转录控制促进上皮细胞增殖

Jinkuk Choi先生等。 公共科学图书馆-基因. 2008年1月.

摘要

端粒酶在干细胞功能和组织稳态中起着关键作用。这种作用取决于其合成端粒重复序列的能力,其方式依赖于其蛋白质组分端粒酶RT(TERT)的逆转录酶(RT)功能,以及其机制尚不清楚的新途径。在这里,我们使用缺乏RT功能的TERT突变体(TERT(ci))来研究哺乳动物皮肤中TERT作用的机制,哺乳动物皮肤是研究祖细胞生物学的理想组织。我们发现,TERT(ci)在促进皮肤角质形成细胞增殖和激活休眠毛囊干细胞方面保留了野生型TERT的全部活性,从而触发新毛囊生长期的启动并促进毛发合成。为了了解TERT这种RT非依赖性功能的性质,我们研究了小鼠皮肤中TERT水平急性变化的全基因组转录反应。我们发现,TERT通过触发基因表达的快速变化,促进皮肤和毛囊中祖细胞的激活,该基因表达与控制野生型小鼠自然毛囊循环的程序显著重叠。使用模式匹配算法与其他微阵列基因集进行的统计比较表明,TERT转录反应与Myc和Wnt介导的反应非常相似,这两种蛋白质与干细胞功能和癌症密切相关。这些数据表明,TERT通过一个在Myc和Wnt通路上汇合的发育程序的转录调控来控制组织祖细胞。

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数字

图1
图1。催化失活TERT蛋白的条件表达诱导毛囊的生成阶段
(A) TERT蛋白结构图显示了所有RT中保守的结构域。RT功能需要三种保守的天冬氨酸(如图所示)。将模体A中的D702突变为丙氨酸,以产生小鼠TERTci公司等位基因。(B) 鼠标TERTci公司当转导到TERT中时,不能重建端粒酶活性−/−MEF与TERT内源性端粒酶活性的抑制+/+TRAP的MEF。TRAP活性通过测量带强度进行量化,相对端粒酶活性(RTA)显示在每条通道下方。(C) 毛囊在活跃生长期(生长期)和静止期(休止期)之间循环。E、 表皮;ORS,外根鞘;HS,发干;M、 基质细胞;DP,毛乳头;IRS,内根鞘;B、 隆起干细胞生态位;S、 皮脂腺。(D) Northern blot显示多西环素依赖性抑制iK5-TERT和iK5-ERT背部皮肤中的TERT mRNAci公司老鼠。(E) 任一TERT的导入ci公司或小鼠表皮中的TERT mRNA在50-60天之间启动生长周期。在第10天停用多西环素。对照组包括非转基因、K5-tTA单转基因和tetop-TERTci公司tetop-TERT单转基因小鼠仍处于休止期(星号)。相比之下,iK5-TERTci公司和iK5-TERT小鼠处于生长状态(黑色箭头)。H&E,100×。
图2
图2。TERT(地形)ci公司促进头发生长并激活毛囊干细胞
(A–B)大约在第50天将小鼠剃毛,并在2周后评估毛发生长。注意,对照组剃毛区域的皮肤呈粉红色,即使在14天后仍处于持续休止期。(C)长期BrdU追踪后进行背侧皮肤活检,并在CD34中保留BrdU标签+对非Tg小鼠(中间)和iK5 TERT的凸起干细胞区室进行了评估ci公司老鼠(底部)。未接收到BrdU的非Tg鼠标用作阴性对照(顶部)。绿色,CD34;红色,BrdU;400×. (D) 每个CD34中BrdU阳性细胞数量的量化+凸起区域中的细胞。TERT的条件表达ci公司从毛囊隆起区域的标签保留细胞中去除BrdU标签。共1075 CD34+来自四只非Tg小鼠75个突起和724个CD34的细胞+6个iK5-TERT的65个突起细胞ci公司对小鼠进行分析。误差条表示标准误差。
图3
图3。TERT和TERTci公司增强小鼠皮肤中层间表皮的增殖
(A) TERT或TERT的表达ci公司增加滤泡间表皮的厚度(IFE;黑色箭头)。在第55-60天对背部皮肤进行活检,并用H&E染色。对照包括非转基因和单转基因小鼠。(B) 定量显示iK5-TERT和iK5-PERT的IFE显著增厚ci公司(12个控件,8个iK5-TERT和14个iK5-TERTci公司对小鼠进行分析。第页通过单向方差分析和第页<0.05(学生)t吨-控制和iK5-TERT之间的测试)。(C,E)TERT或TERT的表达ci公司增加IFE基底层的增殖。Ki-67的丰度+iK5-TERT和iK5-PERT的IFE中细胞增加ci公司小鼠在第55-60天。基-67+细胞经DAB(C)(黑色箭头)染色,苏木精复染。角蛋白14和Ki-67(E)的双重免疫染色。绿色,K14;红色,Ki-67。(D,F)Ki-67染色定量显示增殖指数显著增加。(D) Ki-67的数量+每100μm的细胞数。(F) Ki-67的百分比+IFE基底层内的细胞(第页通过单因素方差分析和第页<0.01(按学生)t吨-控制和iK5-TERT之间的测试)。
图4
图4。TERT的急性退出改变发育、信号转导和细胞间信号传导相关基因的表达
(A) 在两组用于微阵列的iK5-TERT小鼠中,出生后启动TERT,诱导第60天生长。在TERT ON或对照样品中,iK5-TERT小鼠不使用强力霉素,TERT表达保持不变(绿色箭头)。在TERT OFF样品中,iK5-TERT小鼠在t吨=0,严重沉默TERT表达(红色箭头)。(B) Northern blot显示注射多西环素后iK5-TERT小鼠TERT mRNA快速沉默。GAPDH用作加载控制。(C) TERT调节基因表达谱的聚类热图(FDR<0.05)。控制=TERT ON+Doxy=TERT OFF(D–E)文氏图,描述了TERT激活基因(D)或TERT抑制基因(E)在每个功能类别中的分布。(F) (D)中分析的TERT-激活基因列表。红色,Bmp或Wnt途径的成分;绿色,细胞周期相关基因;蓝色,具有小鼠表皮表型的基因。注意,并不是所有具有已知功能的基因都是彩色编码的。(G) (E)中分析的TERT抑制基因列表。
图5
图5。定量RT-PCR验证TERT调节基因
(A–B)通过实时PCR验证了与不同功能类别相关的代表性TERT激活基因(A)和TERT抑制基因(B)。(TERT ON=对照组24小时时间点;TERT OFF=强力霉素治疗时间点后24小时;n=3。误差条代表标准误差)。(C) 一些代表性基因的半定量RT-PCR验证。(D) TERT调节基因定量RT-PCR验证的详细结果。
图6
图6。TERT调节正常头发周期中头发生长和抗头发生长基因重叠的协调转录程序
(A) 直方图显示了使用随机生成的与TERT调节基因集(10000个排列)大小相等的基因列表聚集其起始位点的基因频率。TERT调节基因位于87个簇中(黑色箭头),而预期只有33个簇基因。(B) TERT激活的基因富含毛发生长模式基因(100个毛发生长基因;1个抗毛发生长基因,287个其他基因)。(C) TERT抑制基因富含抗毛发生长基因(30个抗毛发生长的基因;1个毛发生长基因;206个其他基因)。在预测毛发生长模式基因(D)或抗毛发生长模式的基因(E)时,由不同的FDR阈值生成的各种TERT激活基因列表和TERT抑制基因列表的(D–E)ROC图。
图7
图7。TERT调节基因与Myc和Wnt调节基因极为相似,富含TCF/LEF结合位点
(A) 典型的GSEA结果表明,Myc和Wnt基因集在我们的TERT调节数据集中高度富集。在每个MSigDB基因集中,水平黑条表示与排序的TERT调节数据集相匹配的基因。基因集名称显示在每个框的顶部,标准化富集分数(NES)显示在底部。注意,NES值为负值表示TERT激活基因富集,而正值表示TERT-抑制基因富集。(B–C)的图形表示顺式-调控基序在不同基因群中的富集。TCF/LEF位点富含TERT激活基因;E2F和Myc结合位点富集于毛发生长基因(B);CRE-BP和Myc位点富含抗毛发生长基因(C)。尽管TCF/LEF位点在整个毛发生长基因集合中没有过度表达,但它们在TERT激活的毛发生长基因子集中显著富集。

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引用人

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