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元分析
.2007年12月18:7:226。
doi:10.186/1471-2407-7-226。

5918例恶性上皮性肿瘤的基因组失衡:染色体CGH数据的探索性meta分析

附属机构
元分析

5918例恶性上皮性肿瘤的基因组失衡:染色体CGH数据的探索性荟萃分析

迈克尔·鲍迪斯. BMC癌症. .

摘要

背景:染色体异常与大多数人类恶性肿瘤有关,某些基因组区域的得失与特定实体有关。

方法:在为Progenetix分子细胞遗传学数据库收集的15429例患者中,通过染色体比较基因组杂交(CGH)分析的5918例恶性上皮性肿瘤被选择用于进一步评估。对于有50多个病例的22个临床病理实体,从具体病例数据中生成基因组不平衡的概要信息并进行分析。

结果:随着整体基因组不稳定性的大幅度变化,重复出现的基因组增益和损耗非常显著。大多数实体在第8季度2表现出频繁的收益,而第20季度、第1季度、第3季度、第5季度、第7季度和第17季度的收益在不同实体中频繁出现。损失“热点”包括3p、4q、13q、17p和18q等。对于临床上不同的实体,如肝细胞癌(ca.)和乳腺导管癌,以及组织学相关实体(不同部位的鳞状细胞癌),发现了相关的平均失衡模式。

结论:虽然CGH可以在上皮性恶性肿瘤中发现基因组谱的大量逐个病例变异,但一组有限的不同组合的染色体失衡可能是典型的致癌现象。关注各个区域应有助于目标基因检测和路径推断。

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数字

图1
图1
5918例恶性上皮性肿瘤中不同肿瘤位点的不平衡染色体数目作为总基因组不稳定性的指标。箱形图显示了每个肿瘤核型中染色体的中位数和分布,以及基因组的全部或部分失衡。仅分析恶性病例(ICD-code####/2或####/3)。
图2
图2
所有情况下的总体失衡模式。对于每个染色体带(862条带分辨率),显示了增益(绿色,向上)和损耗(红色,向下)的病例百分比。
图3
图3
5043个恶性上皮瘤样病变按得失模式聚类,使用先前在一个或多个实体中定义为高度异常的区域(参考表2+3)。对于每种情况(x轴),相应的染色体区域(55个选定带;y轴)显示增益(绿色)和损耗(红色)。顶部的彩色条形码表示病例分配给不同临床病理实体和组织学组(附加文件1中提供了彩色代码)。
图4
图4
根据整体失衡模式对癌症实体进行聚类。对每个选定的染色体区域的畸变进行总结(增益百分比-损耗百分比)。在对各个实体的所有区域进行归一化后,颜色强度表示区域增益和损失对整体像差模式的相对贡献。
图5
图5
根据总体不平衡模式对癌症中不同组织学进行聚类。在这里,最常见的组织学类型根据其整体失衡情况自动分组。由于前列腺腺癌病例与前列腺腺癌患者存在显著差异(最显著的是缺乏1q增益),因此将该组与整个腺癌组分开。
图6
图6
123例11q13增益和伴随近端丢失的癌的单例畸变模式的可视化。案例根据其不平衡模式进行聚类(增益/损耗状态,320频带分辨率)。

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引用人

工具书类

    1. Patau K.个体染色体的鉴定,尤其是在人类中。美国人类遗传学杂志。1960;12:250–276.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. 人类染色体的Giemsa带型。临床遗传学。1972;3:169–179.-公共医学
    1. Speicher MR,Gwyn Ballard S,Ward DC。利用组合多荧光FISH对人类染色体进行核型分析。自然遗传学。1996;12:368–375. doi:10.1038/ng0496-368。-内政部-公共医学
    1. Veldman T,Vignon C,Schrock E,Rowley JD,Ried T。通过多色光谱核型分析检测血液恶性肿瘤中的隐性染色体异常。自然遗传学。1997;15:406–410. doi:10.1038/ng0497-406。-内政部-公共医学
    1. Cremer T,Lichter P,Borden J,Ward DC,Manuelidis L.使用染色体特异性库探针通过原位杂交检测中期和间期肿瘤细胞的染色体畸变。人类遗传学。1988;80:235–246. doi:10.1007/BF01790091。-内政部-公共医学

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