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.2008年1月;15(1):109-11.
doi:10.1038/nsmb1326。 Epub 2007年12月16日。

不同的结合模式规定了JMJD2A-tudor对甲基化组蛋白H3K4和H4K20的识别

附属公司

不同的结合模式规定了JMJD2A-tudor对甲基化组蛋白H3K4和H4K20的识别

李行伟等。 自然结构分子生物学. 2008年1月.

摘要

赖氨酸脱甲基酶JMJD2A具有通过其tudor结构域结合来自两个不同组蛋白序列(H3K4me3和H4K20me3)的三甲基化肽的独特性质。这里,我们使用X射线结晶学和量热法表明,JMJD2A识别出具有相似亲和力的H3K4me3和H4K20me3,它们采用了完全不同的结合模式,在一定程度上,我们能够在JMJD2As中设计出抑制H3K4me3识别但不抑制H4K20me3识别的单点突变,反之亦然。

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图1
图1
JMJD2A杂交tudor结构域与三甲基组蛋白H3和H4肽的相互作用。()JMJD2A-带H4K20me3(左)和H3K4me3(右)的舵的ITC。肽氨基酸序列用红色的甲基化赖氨酸表示。原始滴定数据和综合热量测量分别显示在上下图中。这个K(K)d日和化学计量数(n个)通过拟合一个标准的单相互作用模型得到的结果,以及通过非线性最小二乘分析确定的相关s.d。(b条)JMJD2A-tudor与H4K20me3肽复合物的分子表面和静电势表征。负电荷表面的静电势用红色表示,正电荷表面用蓝色表示。肽用2表示F类o个–Fc(c)电子密度图显示在1.0σ等值线水平。
图2
图2
JMJD2A杂交tudor结构域与H3K4me3和H4K20me3肽的两种不同结合模式。(,b条)JMJD2A与H3K4me3的udor交互站点的特写视图(,PDB 2GFA6)和H4K20me3(b条). 图中显示了参与结合H3K4me3和H4K20me3的JMJD2A-腺体的氨基酸。(c(c))JMJD2A-tudor与H3K4me3(粉红色)和H4K20me3(绿色)叠加的复合物的整体视图,说明了这些肽的相反方向。

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引用人

工具书类

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