HGT检测中的混淆因素:统计误差、联合效应和多种解决方案
摘要
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计算基因组进化简约进化场景的算法,基因组进化是最后一个普遍的共同祖先,原核生物进化中水平基因转移占主导地位。 BMC进化生物学。 2003年1月6日; 3:2. doi:10.1186/1471-2148-3-2。 Epub 2003年1月6日。 BMC进化生物学。 2003 PMID: 12515582 免费PMC文章。 -
水平基因转移模型与细菌系统发育问题。 系统生物学。 2007年8月; 56(4):633-42. doi:10.1080/10635150701546231。 系统生物学。 2007 PMID: 17661231 -
蓝藻特征基因中的水平基因转移。 方法分子生物学。 2009; 532:339-66. doi:10.1007/978-1-60327-853-920。 方法分子生物学。 2009 PMID: 19271195 审查。 -
系统发育和解的模型、算法和程序。 简要生物信息。 2011年9月; 12(5):392-400. doi:10.1093/bib/bbr045。 简要生物信息。 2011 PMID: 21949266 审查。
引用人
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毛虫物种树木和 第页 -伪毛虫基因树。 高级应用数学。 2021年10月; 131:102265. doi:10.1016/j.aam.2021.102265。 Epub 2021年8月23日。 高级应用数学。 2021 PMID: 34483422 免费PMC文章。 -
非匹配毛虫基因树和物种树的道路阻塞单调路径和合并历史计数。 高级应用数学。 2020年2月; 113:101939. doi:10.1016/j.am.2019.101939。 Epub 2019年10月31日。 高级应用数学。 2020 PMID: 32863514 免费PMC文章。 -
通过反足樱桃对基因树和种树的孤独配对进行计数。 高级应用数学。 2019年1月; 102:1-17. doi:10.1016/j.aam.2018.09.001。 Epub 2018年9月14日。 高级应用数学。 2019 PMID: 30983650 免费PMC文章。 -
Orobachaceae五种寄生植物的水平基因转移。 基因组生物进化。 2018年12月1日; 10(12):3196-3210. doi:10.1093/gbe/evy219。 基因组生物进化。 2018 PMID: 30407540 免费PMC文章。 -
用于匹配基因树和物种树的紧凑合并历史的枚举。 数学生物学杂志。 2019年1月; 78(1-2):155-188. doi:10.1007/s00285-018-1271-5。 Epub 2018年8月16日。 数学生物学杂志。 2019 PMID: 30116881 免费PMC文章。