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.2007年3月;39(3):311-8.
doi:10.1038/ng1966。 Epub 2007年2月4日。

人类基因组中转录启动子和增强子的独特和预测染色质特征

附属公司

人类基因组中转录启动子和增强子的独特和预测染色质特征

纳撒尼尔·D·海因茨曼等。 自然基因. 2007年3月.

摘要

真核基因转录伴随着启动子附近核小体的乙酰化和甲基化,但组蛋白修饰在基因组其他地方的位置和作用尚不清楚。我们沿人类基因组的30 Mb高分辨率测定了染色质修饰状态,发现活性启动子以组蛋白H3(H3K4)的Lys4三甲基化为标志,而增强子以H3K3的单甲基化而非三甲基化。我们开发了计算算法,使用这些不同的染色质特征来识别新的调控元件,预测30-Mb区域内超过200个启动子和400个增强子。该方法以高灵敏度和特异性准确预测了独立鉴定的调节元件的位置和功能,并发现了一种新的肉碱转运蛋白SLC22A5(OCTN2)的功能增强剂。我们的结果揭示了染色质修饰和转录调控活性之间的联系,并为人类基因组的功能注释提供了一种新的工具。

PubMed免责声明

中的注释

  • 用染色质增强基因组注释。
    Schübeler D。 Schübeler D。 自然遗传学。2007年3月;39(3):284-5. doi:10.1038/ng0307-284。 自然遗传学。2007 PMID:17325674 没有可用的摘要。

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引用人

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