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.2006年12月;2(12):640-9.
doi:10.1039/b609442b。 Epub 2006年10月23日。

从动态敏感性和可识别性分析深入了解系统生物学模型的行为:NF-kappaB信号通路的个案研究

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从动态敏感性和可识别性分析深入了解系统生物学模型的行为:NF-kappaB信号通路的个案研究

洪岳等。 分子生物晶体. 2006年12月.
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摘要

数学建模提供了多种有用的技术,有助于理解复杂信号转导网络的内在行为。从系统工程的角度来看,代谢和信号转导模型的动力学始终可以用遵循质量平衡原理的非线性常微分方程(ODE)来描述。基于状态空间公式,自动控制领域的许多方法可以方便地应用于细胞网络的建模、分析和设计。在本研究中,对IkappaB-NF-kappaB信号通路系统的模型进行了动态灵敏度分析。对欧几里得形式总体敏感性的单变量分析表明,模型中64个参数中只有8个对核NF-kappaB振荡有主要影响。然后在最小二乘估计和多元分析的框架内,使用灵敏度矩阵进行相关性分析、可识别性评估和测量集选择。结果表明,某些参数对被测变量的影响精确或高度相关。实验设计策略提供了指导,说明测量时应考虑哪些蛋白质,以便以最佳的统计精度估计未知参数。我们描述的整个分析方案为复杂小区网络提供了有效的参数估计技术。

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  • 人类成纤维细胞衰老的系统转录组分析和时间模型。
    Scanlan RL、Pease L、O’Keefe H、Martinez Guimera A、Rasmussen L、Wordsworth J、Shanley D。 Scanlan RL等人。 正面老化。2024年8月29日;5:1448543. doi:10.3389/fragi.2024.1448543。eCollection 2024年。 正面老化。2024 PMID:39267611 免费PMC文章。
  • 全局灵敏度分析中收敛性、抽样和总阶估计对参数正交性的影响。
    Saxton H、Xu X、Schenkel T、Clayton RH、Halliday I。 Saxton H等人。 公共科学图书馆计算生物学。2024年7月17日;20(7):e1011946。doi:10.1371/journal.pcbi.1011946。eCollection 2024年7月。 公共科学图书馆计算生物学。2024 PMID:39018334 免费PMC文章。
  • 典型NF-κB信号通路的可信可识别模型。
    Jaruszewicz-Błonska J、Kosiuk I、Prus W、Lipniacki T。 Jaruszewicz-Błońska J等人。 公共科学图书馆一号。2023年6月2日;18(6):e0286416。doi:10.1371/journal.pone.0286416。eCollection 2023年。 公共科学图书馆一号。2023 PMID:37267242 免费PMC文章。
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    Sreedharan V、Bhalla US、Ramakrishnan N。 Sreedharan V等人。 BMC生物信息学。2023年4月6日;24(1):136. doi:10.1186/s12859-023-05206-2。 BMC生物信息学。2023 PMID:37024783 免费PMC文章。
  • 使用信息几何进行参数估计和不确定性量化。
    夏普JA、勃朗宁AP、Burrage K、辛普森MJ。 夏普JA等人。 J R Soc接口。2022年4月;19(189):20210940. doi:10.1098/rsif.2021.0940。Epub 2022年4月27日。 J R Soc接口。2022 PMID:35472269 免费PMC文章。 审查。

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