A microRNA signature of hypoxia

doi:10.1128/MCB.01395-06

.2007年3月；27(5):1859-67.

doi:10.1128/MCB.01395-06。 Epub 2006年12月28日。

缺氧的microRNA特征

Ritu Kulshreshtha公司¹, 曼纽拉·费拉辛, 西尔维娅·沃伊西克, 拉米罗·加森, Hansjuerg-Alder公司, 弗朗西斯科·阿戈斯托·佩雷斯, 拉马娜·达武鲁里, 刘长工, 卡洛·克罗斯, 马西莫·内格里尼, 乔治·A·卡林, 米尔恰·伊凡

附属公司

PMID： 17194750
预防性维修识别码：项目经理1820461
内政部： 10.1128/MCB.01395-06

缺氧的microRNA特征

Ritu Kulshreshtha公司等。分子细胞生物学. 2007年3月.

.2007年3月；27(5):1859-67.

doi:10.1128/MCB.01395-06。 Epub 2006年12月28日。

作者

Ritu Kulshreshtha公司¹, 曼纽拉·费拉辛, 西尔维娅·沃伊西克, 拉米罗·加尔松, Hansjuerg Alder公司, 弗朗西斯科·阿戈斯托·佩雷斯, 拉马纳·达武卢里, 刘长工, 卡洛·克罗斯, 马西莫·内格里尼, 乔治·A·卡林, 米尔恰·伊凡

附属

¹美国马萨诸塞州波士顿塔夫茨-新英格兰医学中心分子肿瘤研究所，邮编02111。

PMID： 17194750
预防性维修识别码：项目经理1820461
内政部： 10.1128/MCB.01395-06

摘要

最近的研究已经确定了microRNA在许多细胞过程中的关键作用，包括致瘤转化。虽然在理解微RNA的基因调控机制方面取得了重大进展，但对影响这些非编码转录物表达的因素知之甚少。在这里，我们首次证明了缺氧（一种有充分记录的肿瘤微环境因子）与microRNA表达之间的功能联系。基于微阵列的表达谱显示，微RNA的特定谱（包括miR-23、-24、-26、-27、-103、-107、-181、-210和-213）是通过低氧诱导因子依赖机制诱导的。该组的部分成员（miR-26、-107和-210）在缺氧环境中降低促凋亡信号，表明这些转录物对肿瘤形成的影响。有趣的是，绝大多数低氧诱导的microRNA在多种人类肿瘤中也过度表达。

PubMed免责声明

数字

**图1。**
结肠和乳腺癌细胞系中microRNA表达的协同低氧变化。根据至少两种细胞系中缺氧上调的微小RNA的表达对四种细胞系进行聚类分析。表达数据被归一化为时间零点的表达。

**图2。**
通过Northern分析或定量RT-PCR证实缺氧诱导HRM。（a）低氧条件下miR-210诱导的Northern印迹证实（显示成熟形式）。Lanes NOR、6HY和30HY分别在常氧和缺氧6小时和30小时时显示结果。溴化乙锭染色凝胶图片显示为负载控制。（b）定量RT-PCR证实24小时低氧诱导HRM（H）与正常对照组HRM诱导（N）的比较。横线表示两个独立实验的平均值。I形条表示标准偏差。

**图3。**
基于HIF1_Q3（a）或HIF1_Q（b）结合位点的随机23-microRNA组（样本）分布。箭头指示实验数据（HRM）在随机样本总体中的位置，以及相应的*P（P）*值。

**图4。**
HIF对特异性微小RNA表达的影响。通过定量RT-PCR测定HT29（A）和MCF7（b）细胞中外源性组成活性HIF-1α（HIF1P/A）和HIF-2α（HIF2P/A）亚单位对miR-103、-210和-213表达的影响。对照组为pcDNA3.1空载体（PC）。横线表示两个独立实验的平均值。I形条表示标准偏差。

**图5：。**
HIF在选择性HRM上调中的直接作用。HT29细胞中HRM启动子报告子构建的相对荧光素酶活性。（a） pGL3环境中的miR-24-1和-181c启动子；（b） pGL3-tk上下文中的miR-26b片段。这些构建物与组成活性HIF-1α（HIF1P/A）、HIF-2α（HIF2P/A）或空载体pcDNA3.1（PC）共同转染，并在常压（NOR）下培养。此外，还显示了缺氧（HYP）对报告者的影响。横线表示三个独立实验的平均值。I形条表示标准偏差。

**图6。**
缺氧条件下miR-210和miR-26启动子上HIF的直接募集。使用HIF-1α抗体或IgG对照物从HT29细胞中免疫沉淀染色质，并使用跨越位于位置−1720和−1822（210-a）的候选HRE的引物扩增富集的基因组片段miR-210启动子1166（210-B）；或miR-26a-2启动子（26-A）的−2860。miR-130b启动子片段用作阴性对照。

**图7。**
低氧条件下选择性microRNA的抗凋亡作用。用反义抑制剂阻断miR-26、-107和-210可导致三个独立实验中的凋亡反应增加（每个实验均进行三次）。相反，过量的正义microRNA会降低凋亡反应。虚线表示缺氧条件下对阴性对照microRNA的凋亡caspase-3/7基线活性（P，前体[感觉]；A，反义）。（b） Northern blot证实MCF7细胞中miR-210的有效转导或阻断。用前体或反义miR-210或干扰对照（SCR）转染MCF7细胞。U6 snRNA显示为加载控制。

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[1] Bartel，D.P.，2004年。微RNA：基因组学、生物发生、机制和功能。细胞116:281-297。-公共医学

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[3] Calin、G.A.、M.Ferracin、A.Cimmino、G.Di Leva、M.Shimizu、S.E.Wojcik、M.V.Iorio、R.Visone、N.I.Sever、M.Fabbri、R.Iuliano、T.Palumbo、F.Pichiori、C.Roldo、R.Garzon、C.Sevignani、L.Rassenti、H.Alder、S.Volinia、C.G.Liu、T.J.Kipps、M.Negrini和C.M.Croce。与慢性淋巴细胞白血病预后和进展相关的microRNA特征。北英格兰。《医学杂志》353:1793-1801。-公共医学

[4] Calin、G.A.、M.Ferracin、A.Cimmino、G.Di Leva、M.Shimizu、S.E.Wojcik、M.V.Iorio、R.Visone、N.I.Sever、M.Fabbri、R.Iuliano、T.Palumbo、F.Pichiori、C.Roldo、R.Garzon、C.Sevignani、L.Rassenti、H.Alder、S.Volinia、C.G.Liu、T.J.Kipps、M.Negrini和C.M.Croce。与慢性淋巴细胞白血病预后和进展相关的microRNA特征。北英格兰。《医学杂志》353:1793-1801。-公共医学

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[7] Cheng，A.M.、M.W.Byrom、J.Shelton和L.P.Ford。2005.人类miRNA的反义抑制和miRNA参与细胞生长和凋亡的迹象。核酸研究33:1290-1297。-项目管理咨询公司-公共医学

[8] Cheng，A.M.、M.W.Byrom、J.Shelton和L.P.Ford。2005.人类miRNA的反义抑制和miRNA参与细胞生长和凋亡的迹象。核酸研究33:1290-1297。-项目管理咨询公司-公共医学

[9] 克罗齐，C.M.和G.A.卡林。miRNAs、癌症和干细胞分裂。细胞122:6-7。-公共医学

[10] 克罗齐，C.M.和G.A.卡林。miRNAs、癌症和干细胞分裂。细胞122:6-7。-公共医学

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