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.2005:70:51-63.
doi:10.1101/sqb.2005.70.055。

非整倍体和二倍体乳腺肿瘤的高分辨率ROMA CGH和FISH分析

J希克斯 1, L穆图斯瓦米, 克拉斯尼茨, N纳文, M索具, V格鲁博, D埃斯波西托, J亚历山大, J Troge公司, M Wigler公司, S马纳, P伦丁, 扎特伯格
附属公司

非整倍体和二倍体乳腺肿瘤的高分辨率ROMA CGH和FISH分析

J希克斯等。 冷泉Harb Symp-Quant生物. 2005.

摘要

将肿瘤DNA的代表性寡核苷酸微阵列分析（ROMA）与单个肿瘤细胞的荧光原位杂交（FISH）相结合，提供了直接检测和验证冷冻肿瘤样品中广泛扩增、缺失和重排的机会。我们使用这些联合技术检查了101个非整倍体和二倍体乳腺肿瘤，这些肿瘤的长期随访和详细的临床信息可用。我们已经确定，ROMA能够准确、灵敏地检测重复、扩增和缺失，并在大多数情况下以<50 kbp的分辨率确定这些事件的边界。我们发现二倍体肿瘤的平均重排次数少于非整倍体，但重排发生在两种类型的相同位置。二倍体肿瘤至少反映出三种一致的重排模式。这些事件的重复性和频率，特别是在非常早期的肿瘤中，为了解乳腺癌中最早的染色体事件提供了线索。我们还确定了某些重排事件与临床相关参数（如长期生存率）之间的相关性。随着更多样本的分析，这些相关性可能为乳腺癌和其他癌症提供新的预后指标。

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